TCF7L2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2GL7, 1JDH, 1JPW

Ідентифікатори

Символи

TCF7L2, TCF-4, TCF4, transcription factor 7 like 2

Зовнішні ІД

OMIM: 602228 MGI: 1202879 HomoloGene: 7564 GeneCards: TCF7L2

Пов'язані генетичні захворювання

цукровий діабет 2-го типу, біполярний афективний розлад, рак молочної залози, ішемічна хвороба серця, метаболічні захворювання, колоректальний рак^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding • DNA binding • beta-catenin binding • gamma-catenin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • armadillo repeat domain binding • protein kinase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding
Клітинна компонента	• beta-catenin-TCF7L2 complex • PML body • нуклеоплазма • protein-DNA complex • клітинне ядро • transcription regulator complex
Біологічний процес	• positive regulation of heparan sulfate proteoglycan biosynthetic process • positive regulation of protein kinase B signaling • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • glucose homeostasis • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • response to glucose • Wnt signaling pathway • regulation of smooth muscle cell proliferation • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • canonical Wnt signaling pathway involved in positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • transcription, DNA-templated • positive regulation of protein export from nucleus • maintenance of DNA repeat elements • blood vessel development • myoblast fate commitment • canonical Wnt signaling pathway • pancreas development • positive regulation of protein binding • regulation of hormone metabolic process • проліферація • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • fat cell differentiation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • beta-catenin-TCF complex assembly • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway • positive regulation of insulin secretion • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of epithelial cell proliferation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6934


21416

Ensembl


ENSG00000148737


ENSMUSG00000024985

UniProt


Q9NQB0


Q924A0

RefSeq (мРНК)

NM_001146274 NM_001146283 NM_001146284 NM_001146285 NM_001146286
NM_001198525 NM_001198526 NM_001198527 NM_001198528 NM_001198529 NM_001198530 NM_001198531 NM_030756 NM_001349870 NM_001349871 NM_001363501 NM_001367943

NM_001142918 NM_001142919 NM_001142920 NM_001142921 NM_001142922
NM_001142923 NM_001142924 NM_009333 NM_001331135 NM_001331136 NM_001331137 NM_001331138 NM_001331139 NM_001331140 NM_001331141 NM_001331142 NM_001331143 NM_001331144 NM_001331145 NM_001331146 NM_001331147 NM_001331148 NM_001331149 NM_001331150

RefSeq (білок)

NP_001139746 NP_001139755 NP_001139756 NP_001139757 NP_001139758
NP_001185454 NP_001185455 NP_001185456 NP_001185457 NP_001185458 NP_001185459 NP_001185460 NP_110383 NP_001336799 NP_001336800 NP_001350430 NP_001354872 NP_001139757.1

NP_001136390 NP_001136391 NP_001136392 NP_001136393 NP_001136394
NP_001136395 NP_001136396 NP_001318064 NP_001318065 NP_001318066 NP_001318067 NP_001318068 NP_001318069 NP_001318070 NP_001318071 NP_001318072 NP_001318073 NP_001318074 NP_001318075 NP_001318076 NP_001318077 NP_001318078 NP_001318079 NP_033359

Локус (UCSC)

Хр. 10: 112.95 – 113.17 Mb

Хр. 19: 55.73 – 55.92 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TCF7L2 (англ. Transcription factor 7 like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 619 амінокислот, а молекулярна маса — 67 919^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPQLNGGGGD	DLGANDELIS	FKDEGEQEEK	SSENSSAERD	LADVKSSLVN
ESETNQNSSS	DSEAERRPPP	RSESFRDKSR	ESLEEAAKRQ	DGGLFKGPPY
PGYPFIMIPD	LTSPYLPNGS	LSPTARTLHF	QSGSTHYSAY	KTIEHQIAVQ
YLQMKWPLLD	VQAGSLQSRQ	ALKDARSPSP	AHIVSNKVPV	VQHPHHVHPL
TPLITYSNEH	FTPGNPPPHL	PADVDPKTGI	PRPPHPPDIS	PYYPLSPGTV
GQIPHPLGWL	VPQQGQPVYP	ITTGGFRHPY	PTALTVNASM	SRFPPHMVPP
HHTLHTTGIP	HPAIVTPTVK	QESSQSDVGS	LHSSKHQDSK	KEEEKKKPHI
KKPLNAFMLY	MKEMRAKVVA	ECTLKESAAI	NQILGRRWHA	LSREEQAKYY
ELARKERQLH	MQLYPGWSAR	DNYGKKKKRK	RDKQPGETNE	HSECFLNPCL
SLPPITDLSA	PKKCRARFGL	DQQNNWCGPC	RRKKKCVRYI	QGEGSCLSPP
SSDGSLLDSP	PPSPNLLGSP	PRDAKSQTEQ	TQPLSLSLKP	DPLAHLSMMP
PPPALLLAEA	THKASALCPN	GALDLPPAAL	QPAAPSSSIA	QPSTSSLHSH
SSLAGTQPQP	LSLVTKSLE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Barker N., Huls G., Korinek V., Clevers H. (1999). Restricted high level expression of Tcf-4 protein in intestinal and mammary gland epithelium. Am. J. Pathol. 154: 29—35. PMID 9916915 DOI:10.1016/S0002-9440(10)65247-9
Omer C.A., Miller P.J., Diehl R.E., Kral A.M. (1999). Identification of Tcf4 residues involved in high-affinity beta-catenin binding. Biochem. Biophys. Res. Commun. 256: 584—590. PMID 10080941 DOI:10.1006/bbrc.1999.0379
Brantjes H., Roose J., van De Wetering M., Clevers H. (2001). All Tcf HMG box transcription factors interact with Groucho-related co-repressors. Nucleic Acids Res. 29: 1410—1419. PMID 11266540 DOI:10.1093/nar/29.7.1410
Yamamoto H., Ihara M., Matsuura Y., Kikuchi A. (2003). Sumoylation is involved in beta-catenin-dependent activation of Tcf-4. EMBO J. 22: 2047—2059. PMID 12727872 DOI:10.1093/emboj/cdg204
Hecht A., Stemmler M.P. (2003). Identification of a promoter-specific transcriptional activation domain at the C-terminus of the Wnt effector protein T-cell factor 4. J. Biol. Chem. 278: 3776—3785. PMID 12446687 DOI:10.1074/jbc.M210081200

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TCF7L2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11641 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NQB0 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 10

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма