STAT2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2KA4

Ідентифікатори

Символи

STAT2, ISGF-3, P113, STAT113, IMD44, signal transducer and activator of transcription 2, PTORCH3

Зовнішні ІД

OMIM: 600556 MGI: 103039 HomoloGene: 3952 GeneCards: STAT2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • ubiquitin-like protein ligase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • signal transducer activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• receptor signaling pathway via JAK-STAT • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0022415 viral process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of protein phosphorylation • defense response to virus • regulation of mitochondrial fission • type I interferon signaling pathway • cytokine-mediated signaling pathway • defense response • regulation of cell population proliferation • response to peptide hormone • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6773


20847

Ensembl


ENSG00000170581


ENSMUSG00000040033

UniProt


P52630


Q9WVL2

RefSeq (мРНК)

NM_005419 NM_198332 NM_001385110 NM_001385111 NM_001385113
NM_001385114 NM_001385115


NM_019963

RefSeq (білок)


NP_005410 NP_938146


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 12: 56.34 – 56.36 Mb

Хр. 10: 128.11 – 128.13 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

STAT2 (англ. Signal transducer and activator of transcription 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 851 амінокислот, а молекулярна маса — 97 916^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQWEMLQNL	DSPFQDQLHQ	LYSHSLLPVD	IRQYLAVWIE	DQNWQEAALG
SDDSKATMLF	FHFLDQLNYE	CGRCSQDPES	LLLQHNLRKF	CRDIQPFSQD
PTQLAEMIFN	LLLEEKRILI	QAQRAQLEQG	EPVLETPVES	QQHEIESRIL
DLRAMMEKLV	KSISQLKDQQ	DVFCFRYKIQ	AKGKTPSLDP	HQTKEQKILQ
ETLNELDKRR	KEVLDASKAL	LGRLTTLIEL	LLPKLEEWKA	QQQKACIRAP
IDHGLEQLET	WFTAGAKLLF	HLRQLLKELK	GLSCLVSYQD	DPLTKGVDLR
NAQVTELLQR	LLHRAFVVET	QPCMPQTPHR	PLILKTGSKF	TVRTRLLVRL
QEGNESLTVE	VSIDRNPPQL	QGFRKFNILT	SNQKTLTPEK	GQSQGLIWDF
GYLTLVEQRS	GGSGKGSNKG	PLGVTEELHI	ISFTVKYTYQ	GLKQELKTDT
LPVVIISNMN	QLSIAWASVL	WFNLLSPNLQ	NQQFFSNPPK	APWSLLGPAL
SWQFSSYVGR	GLNSDQLSML	RNKLFGQNCR	TEDPLLSWAD	FTKRESPPGK
LPFWTWLDKI	LELVHDHLKD	LWNDGRIMGF	VSRSQERRLL	KKTMSGTFLL
RFSESSEGGI	TCSWVEHQDD	DKVLIYSVQP	YTKEVLQSLP	LTEIIRHYQL
LTEENIPENP	LRFLYPRIPR	DEAFGCYYQE	KVNLQERRKY	LKHRLIVVSN
RQVDELQQPL	ELKPEPELES	LELELGLVPE	PELSLDLEPL	LKAGLDLGPE
LESVLESTLE	PVIEPTLCMV	SQTVPEPDQG	PVSQPVPEPD	LPCDLRHLNT
EPMEIFRNCV	KIEEIMPNGD	PLLAGQNTVD	EVYVSRPSHF	YTDGPLMPSD
F

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]

Fu X.-Y., Schindler C., Improta T., Aebersold R., Darnell J.E. Jr. (1992). The proteins of ISGF-3, the interferon alpha-induced transcriptional activator, define a gene family involved in signal transduction. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 7840—7843. PMID 1502204 DOI:10.1073/pnas.89.16.7840
Yan R., Qureshi S., Zhong Z., Wen Z., Darnell J.E. Jr. (1995). The genomic structure of the STAT genes: multiple exons in coincident sites in Stat1 and Stat2. Nucleic Acids Res. 23: 459—463. PMID 7885841 DOI:10.1093/nar/23.3.459
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fu X.Y. (1992). A transcription factor with SH2 and SH3 domains is directly activated by an interferon alpha-induced cytoplasmic protein tyrosine kinase(s). Cell. 70: 323—335. PMID 1638633 DOI:10.1016/0092-8674(92)90106-M
Leung S., Qureshi S.A., Kerr I.M., Darnell J.E. Jr., Stark G.R. (1995). Role of STAT2 in the alpha interferon signaling pathway. Mol. Cell. Biol. 15: 1312—1317. PMID 7532278 DOI:10.1128/MCB.15.3.1312
Sugiyama T., Nishio Y., Kishimoto T., Akira S. (1996). Identification of alternative splicing form of Stat2. FEBS Lett. 381: 191—194. PMID 8601453 DOI:10.1016/0014-5793(96)00121-4

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11363 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P52630 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма