GTF3A
Ідентифікатори
Символи
GTF3A , AP2, TFIIIA, general transcription factor IIIA
Зовнішні ІД
OMIM : 600860 MGI: 1913846 HomoloGene: 55630 GeneCards: GTF3A
Онтологія гена
Молекулярна функція
• nucleic acid binding • DNA binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding • 5S rRNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• rRNA transcription • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III • ribosomal large subunit biogenesis • ribosome biogenesis • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 13: 27.42 – 27.44 Mb
Хр. 5: 146.89 – 146.89 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
GTF3A (англ. General transcription factor IIIA ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот , а молекулярна маса — 41 515[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDPPAVVAES VSSLTIADAF IAAGESSAPT PPRPALPRRF ICSFPDCSAN
YSKAWKLDAH LCKHTGERPF VCDYEGCGKA FIRDYHLSRH ILTHTGEKPF
VCAANGCDQK FNTKSNLKKH FERKHENQQK QYICSFEDCK KTFKKHQQLK
IHQCQHTNEP LFKCTQEGCG KHFASPSKLK RHAKAHEGYV CQKGCSFVAK
TWTELLKHVR ETHKEEILCE VCRKTFKRKD YLKQHMKTHA PERDVCRCPR
EGCGRTYTTV FNLQSHILSF HEESRPFVCE HAGCGKTFAM KQSLTRHAVV
HDPDKKKMKL KVKKSREKRS LASHLSGYIP PKRKQGQGLS LCQNGESPNC
VEDKMLSTVA VLTLG
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , біогенез рибосом, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК , РНК .
Локалізований у ядрі .
Sloan K.E., Bohnsack M.T., Watkins N.J. (2013). The 5S RNP couples p53 homeostasis to ribosome biogenesis and nucleolar stress. Cell Rep . 5 : 237—247. PMID 24120868 DOI :10.1016/j.celrep.2013.08.049
Moorefield B., Roeder R.G. (1994). Purification and characterization of human transcription factor IIIA. J. Biol. Chem . 269 : 20857—20865. PMID 8063702
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
Стероїдні гормони
Естроген-зв'язувальні
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші