HES6
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| HES6, C-HAIRY1, HES-6, bHLHb41, bHLHc23, hes family bHLH transcription factor 6 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 610331 MGI: 1859852 HomoloGene: 23111 GeneCards: HES6
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • transcription factor binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001106 transcription corepressor activity • sequence-specific DNA binding • sequence-specific double-stranded DNA binding
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • transcription regulator complex
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • диференціація клітин • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somitogenesis • Сигнальний шлях Notch • regulation of neurogenesis • anterior/posterior pattern specification
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 2: 238.24 – 238.24 Mb
| Хр. 1: 91.34 – 91.34 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
HES6 (англ. Hes family bHLH transcription factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот, а молекулярна маса — 24 129[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAPPAAPGRD | | RVGREDEDGW | | ETRGDRKARK | | PLVEKKRRAR | | INESLQELRL |
LLAGAEVQAK | | LENAEVLELT | | VRRVQGVLRG | | RAREREQLQA | | EASERFAAGY |
IQCMHEVHTF | | VSTCQAIDAT | | VAAELLNHLL | | ESMPLREGSS | | FQDLLGDALA |
GPPRAPGRSG | | WPAGGAPGSP | | IPSPPGPGDD | | LCSDLEEAPE | | AELSQAPAEG |
PDLVPAALGS | | LTTAQIARSV | | WRPW |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Локалізований у ядрі.
|
---|
|
(1) Основні домени |
---|
|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) |
|
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) |
|
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) |
|
---|
| (1.4) NF-1 |
|
---|
| (1.5) RF-X |
|
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) |
|
---|
|
| |
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) |
підродина 1 |
|
---|
| підродина 2 |
|
---|
| підродина 3 |
- Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
| підродина 4 |
|
---|
| підродина 5 |
|
---|
| підродина 6 |
|
---|
| підродина 0 |
|
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 |
|
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців |
|
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер |
|
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу |
|
---|
| (2.6) WRKY |
|
---|
|
| |
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
|
(3.1) Гомеобокс |
|
---|
| (3.2) Парний бокс |
|
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль |
|
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку |
|
---|
| (3.5) Триптофановий кластер |
|
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер |
|
---|
|
| |
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
|
(4.1) RHR |
|
---|
| (4.2) STAT |
|
---|
| (4.3) p53 |
|
---|
| (4.4) MADS |
|
---|
| (4.6) TATA |
|
---|
| (4.7) Високомобільна група |
|
---|
| (4.9) Grainyhead |
|
---|
| (4.10) Домен холодового шоку |
|
---|
| (4.11) Runt |
|
---|
|
| |
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
|
(0.2) HMGI(Y) |
|
---|
| (0.3) Pocket домен |
|
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні |
|
---|
| (0.6) Інші |
|
---|
|
|
|