KDM5C
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи KDM5C, DXS1272E, JARID1C, MRX13, MRXJ, MRXSCJ, MRXSJ, SMCX, XE169, lysine demethylase 5C
Зовнішні ІД OMIM: 314690 MGI: 99781 HomoloGene: 79498 GeneCards: KDM5C
Пов'язані генетичні захворювання
syndromic X-linked intellectual disability Claes-Jensen type, X-linked intellectual disability[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_013668
RefSeq (білок)
Локус (UCSC) Хр. X: 53.18 – 53.23 Mb Хр. X: 151.02 – 151.06 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

KDM5C (англ. Lysine demethylase 5C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 560 амінокислот, а молекулярна маса — 175 720[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPA
DWQPPFAVEVDNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSL
KIPNVERRILDLYSLSKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIG
SLLRSHYERIVYPYEMYQSGANLVQCNTRPFDNEEKDKEYKPHSIPLRQS
VQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGL
MAKDKTLRKKDKEGPECPPTVVVKEELGGDVKVESTSPKTFLESKEELSH
SPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLLCDGCDDNYH
IFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEM
ADSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFG
SGFPVSDSKRHLTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVP
WLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMK
KLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRA
YHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICK
MAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELL
PDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYR
YTLDELPAMLHKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESE
ARERRFPNSELLQQLKNCLSEAEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGLQMTL
TELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVLEQVEAYQAEAREALASLPSSPGL
LQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRTLAPSARRGTLAVM
RGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQKHPPA
TLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDD
LEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLE
VLCPCADAGSDSTKRSRWMEKELGLYKSDTELLGLSAQDLRDPGSVIVAF
KEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGAL
QCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNPTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRS
RRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAISWQGRARQALASED
VTALLGRLAELRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMPKVQGL
LENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLE
ELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAERHGSRA
RGRALERRRRRKVDRGGEGDDPAREELEPKRVRSSGPEAEEVQEEEELEE
ETGGEGPPAPIPTTGSPSTQENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLP
CPQQPPQQQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з KDM5C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11114 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
  5. UniProt, P41229 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
  Портал «Біологія»   Портал «Хімія»