TAF4B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1H3O, 2P6V

Ідентифікатори

Символи

TAF4B, SPGF13, TAF2C2, TAFII105, TATA-box binding protein associated factor 4b

Зовнішні ІД

OMIM: 601689 MGI: 2152345 HomoloGene: 28266 GeneCards: TAF4B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • NF-kappaB binding • protein heterodimerization activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • fibrillar center • transcription factor TFIID complex
Біологічний процес	• DNA-templated transcription, initiation • диференціація клітин • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • transcription, DNA-templated • Оогенез • regulation of signal transduction by p53 class mediator • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase II preinitiation complex assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6875


72504

Ensembl


ENSG00000141384


ENSMUSG00000054321

UniProt


Q92750


G5E8Z2

RefSeq (мРНК)


NM_001293725 NM_005640


NM_001100449 NM_001369357 NM_001369358

RefSeq (білок)


NP_001280654 NP_005631


NP_001093919 NP_001356286 NP_001356287

Локус (UCSC)

Хр. 18: 26.23 – 26.39 Mb

Хр. 18: 14.92 – 15.03 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TAF4B (англ. TATA-box binding protein associated factor 4b) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 862 амінокислот, а молекулярна маса — 91 091^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAGLTEPAG	AAPPAAVSAS	GTVTMAPAGA	LPVRVESTPV	ALGAVTKAPV
SVCVEPTASQ	PLRSPVGTLV	TKVAPVSAPP	KVSSGPRLPA	PQIVAVKAPN
TTTIQFPANL	QLPPGTVLIK	SNSGPLMLVS	PQQTVTRAET	TSNITSRPAV
PANPQTVKIC	TVPNSSSQLI	KKVAVTPVKK	LAQIGTTVVT	TVPKPSSVQS
VAVPTSVVTV	TPGKPLNTVT	TLKPSSLGAS	STPSNEPNLK	AENSAAVQIN
LSPTMLENVK	KCKNFLAMLI	KLACSGSQSP	EMGQNVKKLV	EQLLDAKIEA
EEFTRKLYVE	LKSSPQPHLV	PFLKKSVVAL	RQLLPNSQSF	IQQCVQQTSS
DMVIATCTTT	VTTSPVVTTT	VSSSQSEKSI	IVSGATAPRT	VSVQTLNPLA
GPVGAKAGVV	TLHSVGPTAA	TGGTTAGTGL	LQTSKPLVTS	VANTVTTVSL
QPEKPVVSGT	AVTLSLPAVT	FGETSGAAIC	LPSVKPVVSS	AGTTSDKPVI
GTPVQIKLAQ	PGPVLSQPAG	IPQAVQVKQL	VVQQPSGGNE	KQVTTISHSS
TLTIQKCGQK	TMPVNTIIPT	SQFPPASILK	QITLPGNKIL	SLQASPTQKN
RIKENVTSCF	RDEDDINDVT	SMAGVNLNEE	NACILATNSE	LVGTLIQSCK
DEPFLFIGAL	QKRILDIGKK	HDITELNSDA	VNLISQATQE	RLRGLLEKLT
AIAQHRMTTY	KASENYILCS	DTRSQLKFLE	KLDQLEKQRK	DLEEREMLLK
AAKSRSNKED	PEQLRLKQKA	KELQQLELAQ	IQHRDANLTA	LAAIGPRKKR
PLESGIEGLK	DNLLASGTSS	LTATKQLHRP	RITRICLRDL	IFCMEQEREM
KYSRALYLAL	LK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]

Wu Y., Lu Y., Hu Y., Li R. (2005). Cyclic AMP-dependent modification of gonad-selective TAF(II)105 in a human ovarian granulosa cell line. J. Cell. Biochem. 96: 751—759. PMID 16088961 DOI:10.1002/jcb.20577
Dikstein R., Zhou S., Tjian R. (1996). Human TAFII 105 is a cell type-specific TFIID subunit related to hTAFII130. Cell. 87: 137—146. PMID 8858156 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81330-6
Wolstein O., Silkov A., Revach M., Dikstein R. (2000). Specific interaction of TAFII105 with OCA-B is involved in activation of octamer-dependent transcription. J. Biol. Chem. 275: 16459—16465. PMID 10828057 DOI:10.1074/jbc.275.22.16459
Yamit-Hezi A., Nir S., Wolstein O., Dikstein R. (2000). Interaction of TAFII105 with selected p65/RelA dimers is associated with activation of subset of NF-kappa B genes. J. Biol. Chem. 275: 18180—18187. PMID 10849440 DOI:10.1074/jbc.275.24.18180
Rashevsky-Finkel A., Silkov A., Dikstein R. (2001). A composite nuclear export signal in the TBP-associated factor TAFII105. J. Biol. Chem. 276: 44963—44969. PMID 11567023 DOI:10.1074/jbc.M106112200

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11538 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q92750 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 18

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма