ILF3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2L33, 3P1X

Ідентифікатори

Символи

ILF3, CBTF, DRBF, DRBP76, MMP4, MPHOSPH4, MPP4, NF-AT-90, NF110, NF110b, NF90, NF90a, NF90b, NFAR, NFAR-1, NFAR2, TCP110, TCP80, interleukin enhancer binding factor 3, NFAR110, MPP4110, NFAR-2, NF90c, NFAR90, NF90ctv

Зовнішні ІД

OMIM: 603182 MGI: 1339973 HomoloGene: 7785 GeneCards: ILF3

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • double-stranded RNA binding • RNA binding • single-stranded RNA binding • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding
Клітинна компонента	• мембрана • нуклеоплазма • мітохондрія • цитоплазма • ядерце • клітинне ядро • extracellular region • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• defense response to virus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • protein phosphorylation • negative regulation of viral genome replication • negative regulation of translation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3609


16201

Ensembl


ENSG00000129351


ENSMUSG00000032178

UniProt


Q12906


Q9Z1X4

RefSeq (мРНК)


NM_001137673 NM_004516 NM_012218 NM_017620 NM_153464

NM_001042707 NM_001042708 NM_001042709 NM_001277321 NM_001277322
NM_010561

RefSeq (білок)


NP_001131145 NP_004507 NP_036350 NP_060090 NP_703194

NP_001036172 NP_001036173 NP_001036174 NP_001264250 NP_001264251
NP_034691

Локус (UCSC)

Хр. 19: 10.65 – 10.69 Mb

Хр. 9: 21.28 – 21.32 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ILF3 (англ. Interleukin enhancer binding factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 894 амінокислот, а молекулярна маса — 95 338^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRPMRIFVND	DRHVMAKHSS	VYPTQEELEA	VQNMVSHTER	ALKAVSDWID
EQEKGSSEQA	ESDNMDVPPE	DDSKEGAGEQ	KTEHMTRTLR	GVMRVGLVAK
GLLLKGDLDL	ELVLLCKEKP	TTALLDKVAD	NLAIQLAAVT	EDKYEILQSV
DDAAIVIKNT	KEPPLSLTIH	LTSPVVREEM	EKVLAGETLS	VNDPPDVLDR
QKCLAALASL	RHAKWFQARA	NGLKSCVIVI	RVLRDLCTRV	PTWGPLRGWP
LELLCEKSIG	TANRPMGAGE	ALRRVLECLA	SGIVMPDGSG	IYDPCEKEAT
DAIGHLDRQQ	REDITQSAQH	ALRLAAFGQL	HKVLGMDPLP	SKMPKKPKNE
NPVDYTVQIP	PSTTYAITPM	KRPMEEDGEE	KSPSKKKKKI	QKKEEKAEPP
QAMNALMRLN	QLKPGLQYKL	VSQTGPVHAP	IFTMSVEVDG	NSFEASGPSK
KTAKLHVAVK	VLQDMGLPTG	AEGRDSSKGE	DSAEETEAKP	AVVAPAPVVE
AVSTPSAAFP	SDATAEQGPI	LTKHGKNPVM	ELNEKRRGLK	YELISETGGS
HDKRFVMEVE	VDGQKFQGAG	SNKKVAKAYA	ALAALEKLFP	DTPLALDANK
KKRAPVPVRG	GPKFAAKPHN	PGFGMGGPMH	NEVPPPPNLR	GRGRGGSIRG
RGRGRGFGGA	NHGGYMNAGA	GYGSYGYGGN	SATAGYSQFY	SNGGHSGNAS
GGGGGGGGGS	SGYGSYYQGD	NYNSPVPPKH	AGKKQPHGGQ	QKPSYGSGYQ
SHQGQQQSYN	QSPYSNYGPP	QGKQKGYNHG	QGSYSYSNSY	NSPGGGGGSD
YNYESKFNYS	GSGGRSGGNS	YGSGGASYNP	GSHGGYGGGS	GGGSSYQGKQ
GGYSQSNYNS	PGSGQNYSGP	PSSYQSSQGG	YGRNADHSMN	YQYR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]

Xu Y.-H., Grabowski G.A. (1999). Molecular cloning and characterization of a translational inhibitory protein that binds to coding sequences of human acid beta-glucosidase and other mRNAs. Mol. Genet. Metab. 68: 441—454. PMID 10607473 DOI:10.1006/mgme.1999.2934
Duchange N., Pidoux J., Camus E., Sauvaget D. (2000). Alternative splicing in the human interleukin enhancer binding factor 3 (ILF3) gene. Gene. 261: 345—353. PMID 11167023 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00495-9
Saunders L.R., Jurecic V., Barber G.N. (2001). The 90- and 110-kDa human NFAR proteins are translated from two differentially spliced mRNAs encoded on chromosome 19p13. Genomics. 71: 256—259. PMID 11161820 DOI:10.1006/geno.2000.6423
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Matsumoto-Taniura N., Pirollet F., Monroe R., Gerace L., Westendorf J.M. (1996). Identification of novel M phase phosphoproteins by expression cloning. Mol. Biol. Cell. 7: 1455—1469. PMID 8885239 DOI:10.1091/mbc.7.9.1455
Ting N.S.Y., Kao P.N., Chan D.W., Lintott L.G., Lees-Miller S.P. (1998). DNA-dependent protein kinase interacts with antigen receptor response element binding proteins NF90 and NF45. J. Biol. Chem. 273: 2136—2145. PMID 9442054 DOI:10.1074/jbc.273.4.2136

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ILF3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6038 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q12906 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма