POU2F1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1CQT, 1E3O, 1GT0, 1HF0, 1O4X, 1OCT, 1POG

Ідентифікатори

Символи

POU2F1, OCT1, OTF1, oct-1B, POU class 2 homeobox 1, Oct1Z

Зовнішні ІД

OMIM: 164175 MGI: 101898 HomoloGene: 37658 GeneCards: POU2F1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • внутрішньоклітинна мембранна органела • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес	• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5451


18986

Ensembl


ENSG00000143190


ENSMUSG00000026565

UniProt


P14859


P25425

RefSeq (мРНК)


NM_001198783 NM_001198786 NM_002697 NM_001365848 NM_001365849


NM_011137 NM_198932 NM_198933 NM_198934 NM_001368808

RefSeq (білок)


NP_001185712 NP_001185715 NP_002688 NP_001352777 NP_001352778


NP_035267 NP_945150 NP_945151 NP_945152 NP_001355737

Локус (UCSC)

Хр. 1: 167.22 – 167.43 Mb

Хр. 1: 165.69 – 165.83 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

POU2F1 (англ. POU class 2 homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 743 амінокислот, а молекулярна маса — 76 472^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNNPSETSKP	SMESGDGNTG	TQTNGLDFQK	QPVPVGGAIS	TAQAQAFLGH
LHQVQLAGTS	LQAAAQSLNV	QSKSNEESGD	SQQPSQPSQQ	PSVQAAIPQT
QLMLAGGQIT	GLTLTPAQQQ	LLLQQAQAQA	QLLAAAVQQH	SASQQHSAAG
ATISASAATP	MTQIPLSQPI	QIAQDLQQLQ	QLQQQNLNLQ	QFVLVHPTTN
LQPAQFIISQ	TPQGQQGLLQ	AQNLLTQLPQ	QSQANLLQSQ	PSITLTSQPA
TPTRTIAATP	IQTLPQSQST	PKRIDTPSLE	EPSDLEELEQ	FAKTFKQRRI
KLGFTQGDVG	LAMGKLYGND	FSQTTISRFE	ALNLSFKNMC	KLKPLLEKWL
NDAENLSSDS	SLSSPSALNS	PGIEGLSRRR	KKRTSIETNI	RVALEKSFLE
NQKPTSEEIT	MIADQLNMEK	EVIRVWFCNR	RQKEKRINPP	SSGGTSSSPI
KAIFPSPTSL	VATTPSLVTS	SAATTLTVSP	VLPLTSAAVT	NLSVTGTSDT
TSNNTATVIS	TAPPASSAVT	SPSLSPSPSA	SASTSEASSA	SETSTTQTTS
TPLSSPLGTS	QVMVTASGLQ	TAAAAALQGA	AQLPANASLA	AMAAAAGLNP
SLMAPSQFAA	GGALLSLNPG	TLSGALSPAL	MSNSTLATIQ	ALASGGSLPI
TSLDATGNLV	FANAGGAPNI	VTAPLFLNPQ	NLSLLTSNPV	SLVSAAAASA
GNSAPVASLH	ATSTSAESIQ	NSLFTVASAS	GAASTTTTAS	KAQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]

Sturm R.A., Das G., Herr W. (1988). The ubiquitous octamer-binding protein Oct-1 contains a POU domain with a homeo box subdomain. Genes Dev. 2: 1582—1599. PMID 2905684 DOI:10.1101/gad.2.12a.1582
Luchina N.N., Krivega I.V., Pankratova E.V. (2003). Human Oct-1L isoform has tissue-specific expression pattern similar to Oct-2. Immunol. Lett. 85: 237—241. PMID 12663137 DOI:10.1016/S0165-2478(02)00179-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Segil N., Roberts S.B., Heintz N. (1991). Mitotic phosphorylation of the Oct-1 homeodomain and regulation of Oct-1 DNA binding activity. Science. 254: 1814—1816. PMID 1684878 DOI:10.1126/science.1684878
Mahajan S.S., Wilson A.C. (2000). Mutations in host cell factor 1 separate its role in cell proliferation from recruitment of VP16 and LZIP. Mol. Cell. Biol. 20: 919—928. PMID 10629049 DOI:10.1128/MCB.20.3.919-928.2000
Wysocka J., Herr W. (2003). The herpes simplex virus VP16-induced complex: the makings of a regulatory switch. Trends Biochem. Sci. 28: 294—304. PMID 12826401 DOI:10.1016/S0968-0004(03)00088-4

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9212 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P14859 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 1

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.