ERV3-1

Ідентифікатори

ERV3-1, ERV-R, ERV3, ERVR, HERV-R, HERVR, envR, endogenous retrovirus group 3 member 1, endogenous retrovirus group 3 member 1, envelope

Зовнішні ІД

OMIM: 131170 HomoloGene: 128310 GeneCards: ERV3-1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• молекулярна функція
Клітинна компонента	• вірусна оболонка • Віріон • екзосома
Біологічний процес	• GO:0022610 життєдіяльність
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2086


н/д

Ensembl


н/д


н/д

UniProt


Q14264


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001007253 NM_001396062


н/д

RefSeq (білок)


NP_001007254


н/д

Локус (UCSC)

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

ERV3-1 (англ. Endogenous retrovirus group 3 member 1, envelope) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 604 амінокислот, а молекулярна маса — 67 942^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLGMNMLLIT	LFLLLPLSML	KGEPWEGCLH	CTHTTWSGNI	MTKTLLYHTY
YECAGTCLGT	CTHNQTTYSV	CDPGRGQPYV	CYDPKSSPGT	WFEIHVGSKE
GDLLNQTKVF	PSGKDVVSLY	FDVCQIVSMG	SLFPVIFSSM	EYYSSCHKNR
YAHPACSTDS	PVTTCWDCTT	WSTNQQSLGP	IMLTKIPLEP	DCKTSTCNSV
NLTILEPDQP	IWTTGLKAPL	GARVSGEEIG	PGAYVYLYII	KKTRTRSTQQ
FRVFESFYEH	VNQKLPEPPP	LASNLFAQLA	ENIASSLHVA	SCYVCGGMNM
GDQWPWEARE	LMPQDNFTLT	ASSLEPAPSS	QSIWFLKTSI	IGKFCIARWG
KAFTDPVGEL	TCLGQQYYNE	TLGKTLWRGK	SNNSESPHPS	PFSRFPSLNH
SWYQLEAPNT	WQAPSGLYWI	CGPQAYRQLP	AKWSGACVLG	TIRPSFFLMP
LKQGEALGYP	IYDETKRKSK	RGITIGDWKD	NEWPPERIIQ	YYGPATWAED
GMWGYRTPVY	MLNRIIRLQA	VLEIITNETA	GALNLLAQQA	TKMRNVIYQN
RLALDYLLAQ	EEGVCGKFNL	TNCCLELDDE	GKVIKEITAK	IQKLAHIPVQ
TWKG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Література

[ред. | ред. код]

Cohen M., Powers M., O'Connell C., Kato N. (1985). The nucleotide sequence of the env gene from the human provirus ERV3 and isolation and characterization of an ERV3-specific cDNA. Virology. 147: 449—458. PMID 3840930 DOI:10.1016/0042-6822(85)90147-3
Venables P.J.W., Brookes S.M., Griffiths D., Weiss R.A., Boyd M.T. (1995). Abundance of an endogenous retroviral envelope protein in placental trophoblasts suggests a biological function. Virology. 211: 589—592. PMID 7645262 DOI:10.1006/viro.1995.1442
Lin L., Xu B., Rote N.S. (2000). The cellular mechanism by which the human endogenous retrovirus ERV-3 env gene affects proliferation and differentiation in a human placental trophoblast model, BeWo. Placenta. 21: 73—78. PMID 10692254 DOI:10.1053/plac.1999.0443
Blaise S., de Parseval N., Benit L., Heidmann T. (2003). Genomewide screening for fusogenic human endogenous retrovirus envelopes identifies syncytin 2, a gene conserved on primate evolution. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 13013—13018. PMID 14557543 DOI:10.1073/pnas.2132646100
de Parseval N., Lazar V., Casella J.-F., Benit L., Heidmann T. (2003). Survey of human genes of retroviral origin: identification and transcriptome of the genes with coding capacity for complete envelope proteins. J. Virol. 77: 10414—10422. PMID 12970426 DOI:10.1128/JVI.77.19.10414-10422.2003
Rasmussen H.B., Clausen J. (1998). Large number of polymorphic nucleotides and a termination codon in the env gene of the endogenous human retrovirus ERV3. Dis. Markers. 14: 127—133. PMID 10427470 DOI:10.1155/1998/958379

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3454 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q14264 (англ.) . Архів оригіналу за 29 листопада 2016. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2
(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)
(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR
підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX
підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ
підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1
підродина 5	LRH-1 SF1
підродина 6	GCNF
підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2
(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4
(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4
(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2
(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5
(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6
(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63
(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF
(4.6) TATA	TBP TBPL1
(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4
(4.9) Grainyhead	TFCP2
(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1
(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1
(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2
(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3
(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма