TCF3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2MH0, 2YPA, 2YPB, 3U5V

Ідентифікатори

Символи

TCF3, E2A, E47, ITF1, TCF-3, VDIR, bHLHb21, AGM8, transcription factor 3, p75

Зовнішні ІД

OMIM: 147141 MGI: 98510 HomoloGene: 2408 GeneCards: TCF3

Пов'язані генетичні захворювання

лімфогранульоматоз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • mitogen-activated protein kinase kinase kinase binding • vitamin D response element binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • bHLH transcription factor binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • transcription regulator complex • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро • nuclear speck • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of muscle cell differentiation • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • B cell lineage commitment • positive regulation of cell cycle • positive regulation of B cell proliferation • positive regulation of neuron differentiation • B cell differentiation • immunoglobulin V(D)J recombination • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of hematopoietic stem cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6929


21423

Ensembl


ENSG00000071564


ENSMUSG00000020167

UniProt


P15923


P15806

RefSeq (мРНК)


NM_001136139 NM_003200 NM_001351778 NM_001351779

NM_001164147 NM_001164148 NM_001164149 NM_001164150 NM_001164151
NM_001164152 NM_001164153 NM_011548 NM_001378903 NM_001378904 NM_001378905 NM_001378908 NM_001378910 NM_001378912 NM_001378913 NM_001378914

RefSeq (білок)


NP_001129611 NP_003191 NP_001338707 NP_001338708

NP_001157619 NP_001157620 NP_001157621 NP_001157622 NP_001157623
NP_001157624 NP_001157625 NP_035678 NP_001365832 NP_001365833 NP_001365834 NP_001365837 NP_001365839 NP_001365841 NP_001365842 NP_001365843

Локус (UCSC)

Хр. 19: 1.61 – 1.65 Mb

Хр. 10: 80.25 – 80.27 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TCF3 (англ. Transcription factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 654 амінокислот, а молекулярна маса — 67 600^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNQPQRMAPV	GTDKELSDLL	DFSMMFPLPV	TNGKGRPASL	AGAQFGGSGL
EDRPSSGSWG	SGDQSSSSFD	PSRTFSEGTH	FTESHSSLSS	STFLGPGLGG
KSGERGAYAS	FGRDAGVGGL	TQAGFLSGEL	ALNSPGPLSP	SGMKGTSQYY
PSYSGSSRRR	AADGSLDTQP	KKVRKVPPGL	PSSVYPPSSG	EDYGRDATAY
PSAKTPSSTY	PAPFYVADGS	LHPSAELWSP	PGQAGFGPML	GGGSSPLPLP
PGSGPVGSSG	SSSTFGGLHQ	HERMGYQLHG	AEVNGGLPSA	SSFSSAPGAT
YGGVSSHTPP	VSGADSLLGS	RGTTAGSSGD	ALGKALASIY	SPDHSSNNFS
SSPSTPVGSP	QGLAGTSQWP	RAGAPGALSP	SYDGGLHGLQ	SKIEDHLDEA
IHVLRSHAVG	TAGDMHTLLP	GHGALASGFT	GPMSLGGRHA	GLVGGSHPED
GLAGSTSLMH	NHAALPSQPG	TLPDLSRPPD	SYSGLGRAGA	TAAASEIKRE
EKEDEENTSA	ADHSEEEKKE	LKAPRARTSP	DEDEDDLLPP	EQKAEREKER
RVANNARERL	RVRDINEAFK	ELGRMCQLHL	NSEKPQTKLL	ILHQAVSVIL
NLEQQVRERN	LNPKAACLKR	REEEKVSGVV	GDPQMVLSAP	HPGLSEAHNP
AGHM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]

Kamps M.P., Murre C., Sun X.-H., Baltimore D. (1990). A new homeobox gene contributes the DNA binding domain of the t(1;19) translocation protein in pre-B ALL. Cell. 60: 547—555. PMID 1967983 DOI:10.1016/0092-8674(90)90658-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Murre C., McCaw P.S., Baltimore D. (1989). A new DNA binding and dimerization motif in immunoglobulin enhancer binding, daughterless, MyoD, and myc proteins. Cell. 56: 777—783. PMID 2493990 DOI:10.1016/0092-8674(89)90682-X
Henthorn P., McCarrick-Walmsley R., Kadesch T. (1990). Sequence of the cDNA encoding ITF-1, a positive-acting transcription factor. Nucleic Acids Res. 18: 677—677. PMID 2308859 DOI:10.1093/nar/18.3.677
Zhang Y., Bina M. (1991). Sequence of a HeLa cDNA provides the DNA binding domain and carboxy terminus of HE47: a human helix-loop-helix protein related to the enhancer binding factor E47. DNA Seq. 2: 197—202. PMID 1818757 DOI:10.3109/10425179109039690
Henthorn P., Kiledjian M., Kadesch T. (1990). Two distinct transcription factors that bind the immunoglobulin enhancer microE5/kappa 2 motif. Science. 247: 467—470. PMID 2105528 DOI:10.1126/science.2105528

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TCF3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11633 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P15923 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма