HSF1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2LDU, 5D5U, 5D5V

Ідентифікатори

Символи

HSF1, HSTF1, heat shock transcription factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 140580 MGI: 96238 HomoloGene: 74556 GeneCards: HSF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • sequence-specific single stranded DNA binding • DNA binding • protein kinase binding • heat shock protein binding • chromatin DNA binding • identical protein binding • sequence-specific DNA binding • protein self-association • protein heterodimerization activity • Hsp90 protein binding • translation elongation factor binding • promoter-specific chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • STAT family protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • Пронуклеус • GO:0035327 Еухроматин • GO:0035328 Гетерохроматин • клітинне ядро • центросома • гіалоплазма • PML body • nuclear stress granule • mitotic spindle pole • Рибонуклеопротеїни • центромера • кінетохор • spindle pole • нуклеоплазма • хромосома • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • perinuclear region of cytoplasm • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• defense response • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • embryonic placenta development • mRNA transcription • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • response to heat • female meiotic nuclear division • transcription, DNA-templated • embryonic process involved in female pregnancy • protein phosphorylation • response to lipopolysaccharide • Сперматогенез • positive regulation of multicellular organism growth • negative regulation of tumor necrosis factor production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • response to organonitrogen compound • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of gene expression • cellular response to amino acid stimulus • cellular response to hydrogen peroxide • positive regulation of microtubule binding • response to peptide • cellular response to nitroglycerin • negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process • response to estradiol • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • cellular response to potassium ion • response to amino acid • negative regulation of inclusion body assembly • positive regulation of apoptotic DNA fragmentation • cellular response to L-glutamine • response to psychosocial stress • GO:1904578 response to organic cyclic compound • negative regulation of neuron death • response to nutrient • cellular response to angiotensin • response to testosterone • response to hypobaric hypoxia • response to activity • cellular response to radiation • cellular response to estradiol stimulus • positive regulation of inclusion body assembly • MAPK cascade • positive regulation of cell population proliferation • cellular response to heat • Unfolded Protein Response • regulation of protein heterodimerization activity • positive regulation of mitotic cell cycle • protein homooligomerization • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to heat stress • protein homotrimerization • cellular response to cadmium ion • cellular response to copper ion • cellular response to gamma radiation • cellular response to diamide • regulation of cellular response to heat • positive regulation of mRNA polyadenylation • cellular response to sodium arsenite • negative regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining • GO:0100026 Репарація ДНК • mRNA processing • cellular response to DNA damage stimulus • mRNA transport • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • positive regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3297


15499

Ensembl


ENSG00000185122 ENSG00000284774


ENSMUSG00000022556

UniProt


Q00613


P38532

RefSeq (мРНК)


NM_005526


NM_008296

RefSeq (білок)


NP_005517


NP_001318081 NP_001318082 NP_001318083 NP_001318143 NP_032322

Локус (UCSC)

Хр. 8: 144.29 – 144.31 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HSF1 (англ. Heat shock transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 529 амінокислот, а молекулярна маса — 57 260^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDLPVGPGAA	GPSNVPAFLT	KLWTLVSDPD	TDALICWSPS	GNSFHVFDQG
QFAKEVLPKY	FKHNNMASFV	RQLNMYGFRK	VVHIEQGGLV	KPERDDTEFQ
HPCFLRGQEQ	LLENIKRKVT	SVSTLKSEDI	KIRQDSVTKL	LTDVQLMKGK
QECMDSKLLA	MKHENEALWR	EVASLRQKHA	QQQKVVNKLI	QFLISLVQSN
RILGVKRKIP	LMLNDSGSAH	SMPKYSRQFS	LEHVHGSGPY	SAPSPAYSSS
SLYAPDAVAS	SGPIISDITE	LAPASPMASP	GGSIDERPLS	SSPLVRVKEE
PPSPPQSPRV	EEASPGRPSS	VDTLLSPTAL	IDSILRESEP	APASVTALTD
ARGHTDTEGR	PPSPPPTSTP	EKCLSVACLD	KNELSDHLDA	MDSNLDNLQT
MLSSHGFSVD	TSALLDLFSP	SVTVPDMSLP	DLDSSLASIQ	ELLSPQEPPR
PPEAENSSPD	SGKQLVHYTA	QPLFLLDPGS	VDTGSNDLPV	LFELGEGSYF
SEGDGFAEDP	TISLLTGSEP	PKAKDPTVS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, відповідь на стрес, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, пошкодження ДНК, репарація ДНК, транспорт мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах, центромерах, кінетохорі.

Література

[ред. | ред. код]

Rabindran S.K., Giorgi G., Clos J., Wu C. (1991). Molecular cloning and expression of a human heat shock factor, HSF1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 6906—6910. PMID 1871105 DOI:10.1073/pnas.88.16.6906
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Schuetz T.J., Gallo G.J., Sheldon L., Tempst P., Kingston R.E. (1991). Isolation of a cDNA for HSF2: evidence for two heat shock factor genes in humans. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 6911—6915. PMID 1871106 DOI:10.1073/pnas.88.16.6911
Abravaya K., Phillips B., Morimoto R.I. (1991). Heat shock-induced interactions of heat shock transcription factor and the human hsp70 promoter examined by in vivo footprinting. Mol. Cell. Biol. 11: 586—592. PMID 1986252 DOI:10.1128/MCB.11.1.586
Baler R., Dahl G., Voellmy R. (1993). Activation of human heat shock genes is accompanied by oligomerization, modification, and rapid translocation of heat shock transcription factor HSF1. Mol. Cell. Biol. 13: 2486—2496. PMID 8455624 DOI:10.1128/MCB.13.4.2486
Rabindran S.K., Wisniewski J., Li L., Li G.C., Wu C. (1994). Interaction between heat shock factor and hsp70 is insufficient to suppress induction of DNA-binding activity in vivo. Mol. Cell. Biol. 14: 6552—6560. PMID 7935376 DOI:10.1128/MCB.14.10.6552

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5224 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q00613 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма