CTCF
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CTCF, MRD21, CCCTC-binding factor, FAP108, CFAP108
Зовнішні ІД OMIM: 604167 MGI: 109447 HomoloGene: 4786 GeneCards: CTCF
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 21, syndromic intellectual disability[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001191022
NM_006565
NM_001363916
NM_181322
NM_001358924
RefSeq (білок)
NP_001177951
NP_006556
NP_001350845
Локус (UCSC) Хр. 16: 67.56 – 67.64 Mb Хр. 8: 105.64 – 105.68 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CTCF (англ. CCCTC-binding factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 727 амінокислот, а молекулярна маса — 82 785[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEGDAVEAIVEESETFIKGKERKTYQRRREGGQEEDACHLPQNQTDGGEV
VQDVNSSVQMVMMEQLDPTLLQMKTEVMEGTVAPEAEAAVDDTQIITLQV
VNMEEQPINIGELQLVQVPVPVTVPVATTSVEELQGAYENEVSKEGLAES
EPMICHTLPLPEGFQVVKVGANGEVETLEQGELPPQEDPSWQKDPDYQPP
AKKTKKTKKSKLRYTEEGKDVDVSVYDFEEEQQEGLLSEVNAEKVVGNMK
PPKPTKIKKKGVKKTFQCELCSYTCPRRSNLDRHMKSHTDERPHKCHLCG
RAFRTVTLLRNHLNTHTGTRPHKCPDCDMAFVTSGELVRHRRYKHTHEKP
FKCSMCDYASVEVSKLKRHIRSHTGERPFQCSLCSYASRDTYKLKRHMRT
HSGEKPYECYICHARFTQSGTMKMHILQKHTENVAKFHCPHCDTVIARKS
DLGVHLRKQHSYIEQGKKCRYCDAVFHERYALIQHQKSHKNEKRFKCDQC
DYACRQERHMIMHKRTHTGEKPYACSHCDKTFRQKQLLDMHFKRYHDPNF
VPAAFVCSKCGKTFTRRNTMARHADNCAGPDGVEGENGGETKKSKRGRKR
KMRSKKEDSSDSENAEPDLDDNEDEEEPAVEIEPEPEPQPVTPAPPPAKK
RRGRPPGRTNQPKQNQPTAIIQVEDQNTGAIENIIVEVKKEPDAEPAEGE
EEEAQPAATDAPNGDLTPEMILSMMDR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, розходження хромосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

[ред. | ред. код]

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з CTCF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13723 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, P49711 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
  Портал «Біологія»   Портал «Хімія»