LAMP1

Ідентифікатори

LAMP1, CD107a, LAMPA, LGP120, lysosomal associated membrane protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 153330 MGI: 96745 HomoloGene: 4061 GeneCards: LAMP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding • virus receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • multivesicular body • phagolysosome membrane • везикула • ендосома • late endosome • мембрана • Синаптичні бульбашки • cytolytic granule • Меланосома • integral component of plasma membrane • alveolar lamellar body • cell surface • lysosomal membrane • neuronal cell body • вакуоля • дендрит (нейробіологія) • phagocytic vesicle • perinuclear region of cytoplasm • Сарколема • лізосома • endosome membrane • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • external side of plasma membrane • гіалоплазма • цитоплазма • клітинна мембрана • azurophil granule membrane • autolysosome • ficolin-1-rich granule membrane • integral component of synaptic vesicle membrane • late endosome membrane
Біологічний процес	• protein stabilization • Golgi to lysosome transport • positive regulation of natural killer cell degranulation • regulation of organelle transport along microtubule • viral entry into host cell • GO:0022415 viral process • establishment of protein localization to organelle • positive regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity • granzyme-mediated apoptotic signaling pathway • autophagic cell death • neutrophil degranulation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3916


16783

Ensembl


ENSG00000185896


ENSMUSG00000031447

UniProt


P11279


P11438

RefSeq (мРНК)


NM_005561


NM_010684 NM_001317353

RefSeq (білок)


NP_005552


NP_001304282 NP_034814

Локус (UCSC)

Хр. 13: 113.3 – 113.32 Mb

Хр. 8: 13.21 – 13.23 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LAMP1 (англ. Lysosomal associated membrane protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 417 амінокислот, а молекулярна маса — 44 882^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAPGSARRP	LLLLLLLLLL	GLMHCASAAM	FMVKNGNGTA	CIMANFSAAF
SVNYDTKSGP	KNMTFDLPSD	ATVVLNRSSC	GKENTSDPSL	VIAFGRGHTL
TLNFTRNATR	YSVQLMSFVY	NLSDTHLFPN	ASSKEIKTVE	SITDIRADID
KKYRCVSGTQ	VHMNNVTVTL	HDATIQAYLS	NSSFSRGETR	CEQDRPSPTT
APPAPPSPSP	SPVPKSPSVD	KYNVSGTNGT	CLLASMGLQL	NLTYERKDNT
TVTRLLNINP	NKTSASGSCG	AHLVTLELHS	EGTTVLLFQF	GMNASSSRFF
LQGIQLNTIL	PDARDPAFKA	ANGSLRALQA	TVGNSYKCNA	EEHVRVTKAF
SVNIFKVWVQ	AFKVEGGQFG	SVEECLLDEN	SMLIPIAVGG	ALAGLVLIVL
IAYLVGRKRS	HAGYQTI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Viitala J., Carlsson S.R., Siebert P.D., Fukuda M. (1988). Molecular cloning of cDNAs encoding lamp A, a human lysosomal membrane glycoprotein with apparent Mr approximately equal to 120,000. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 3743—3747. PMID 3131762 DOI:10.1073/pnas.85.11.3743
Carlsson S.R., Lycksell P.-O., Fukuda M. (1993). Assignment of O-glycan attachment sites to the hinge-like regions of human lysosomal membrane glycoproteins lamp-1 and lamp-2. Arch. Biochem. Biophys. 304: 65—73. PMID 8323299 DOI:10.1006/abbi.1993.1322
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
Johansson M., Lehto M., Tanhuanpaeae K., Cover T.L., Olkkonen V.M. (2005). The oxysterol-binding protein homologue ORP1L interacts with Rab7 and alters functional properties of late endocytic compartments. Mol. Biol. Cell. 16: 5480—5492. PMID 16176980 DOI:10.1091/mbc.E05-03-0189
Fukuda M., Viitala J., Matteson J., Carlsson S.R. (1988). Cloning of cDNAs encoding human lysosomal membrane glycoproteins, h-lamp-1 and h-lamp-2. Comparison of their deduced amino acid sequences. J. Biol. Chem. 263: 18920—18928. PMID 3198605

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6499 (англ.) . Процитовано 27 лютого 2017.
↑ UniProt, P11279 (англ.) . Архів оригіналу за 4 лютого 2017. Процитовано 27 лютого 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 13

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.