CLEC4M

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1K9J, 1SL6, 1XAR, 1XPH, 3JQH

Ідентифікатори

Символи

CLEC4M, CD209L, CD299, DC-SIGN2, DC-SIGNR, DCSIGNR, HP10347, L-SIGN, LSIGN, C-type lectin domain family 4 member M

Зовнішні ІД

OMIM: 605872 MGI: 2157942 HomoloGene: 129771 GeneCards: CLEC4M

Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding • virus receptor activity • зв'язування з іоном металу • calcium-dependent protein binding • mannose binding • virion binding • ICAM-3 receptor activity • carbohydrate binding • signaling receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • host cell
Біологічний процес	• leukocyte cell-cell adhesion • cell-cell recognition • GO:0046795 intracellular transport of virus • GO:0007243 intracellular signal transduction • antigen processing and presentation • ендоцитоз • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • viral genome replication • peptide antigen transport • modulation by virus of host process • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • virion attachment to host cell • viral entry into host cell
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10332


170786

Ensembl


ENSG00000104938


ENSMUSG00000031494

UniProt


Q9H2X3


Q91ZX1

RefSeq (мРНК)

NM_001144904 NM_001144905 NM_001144906 NM_001144907 NM_001144908
NM_001144909 NM_001144910 NM_001144911 NM_014257 NM_214675 NM_214676


NM_133238

RefSeq (білок)

NP_001138376 NP_001138377 NP_001138378 NP_001138379 NP_001138380
NP_001138381 NP_001138382 NP_001138383 NP_055072


NP_573501

Локус (UCSC)

Хр. 19: 7.76 – 7.77 Mb

Хр. 8: 3.79 – 3.8 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLEC4M (англ. C-type lectin domain family 4 member M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 45 350^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSDSKEPRVQ	QLGLLEEDPT	TSGIRLFPRD	FQFQQIHGHK	SSTGCLGHGA
LVLQLLSFML	LAGVLVAILV	QVSKVPSSLS	QEQSEQDAIY	QNLTQLKAAV
GELSEKSKLQ	EIYQELTQLK	AAVGELPEKS	KLQEIYQELT	RLKAAVGELP
EKSKLQEIYQ	ELTRLKAAVG	ELPEKSKLQE	IYQELTRLKA	AVGELPEKSK
LQEIYQELTE	LKAAVGELPE	KSKLQEIYQE	LTQLKAAVGE	LPDQSKQQQI
YQELTDLKTA	FERLCRHCPK	DWTFFQGNCY	FMSNSQRNWH	DSVTACQEVR
AQLVVIKTAE	EQNFLQLQTS	RSNRFSWMGL	SDLNQEGTWQ	WVDGSPLSPS
FQRYWNSGEP	NNSGNEDCAE	FSGSGWNDNR	CDVDNYWICK	KPAACFRDE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]

Yokoyama-Kobayashi M., Yamaguchi T., Sekine S., Kato S. (1999). Selection of cDNAs encoding putative type II membrane proteins on the cell surface from a human full-length cDNA bank. Gene. 228: 161—167. PMID 10072769 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00004-9
Soilleux E.J., Barten R., Trowsdale J. (2000). DC-SIGN, a related gene, DC-SIGNR, and CD23 form a cluster on 19p13. J. Immunol. 165: 2937—2942. PMID 10975799 DOI:10.4049/jimmunol.165.6.2937
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mitchell D.A., Fadden A.J., Drickamer K. (2001). A novel mechanism of carbohydrate recognition by the C-type lectins DC-SIGN and DC-SIGNR. Subunit organization and binding to multivalent ligands. J. Biol. Chem. 276: 28939—28945. PMID 11384997 DOI:10.1074/jbc.M104565200
Jeffers S.A., Hemmila E.M., Holmes K.V. (2006). Human coronavirus 229E can use CD209L (L-SIGN) to enter cells. Adv. Exp. Med. Biol. 581: 265—269. PMID 17037540 DOI:10.1007/978-0-387-33012-9_44
da Silva R.C., Segat L., Crovella S. (2011). Role of DC-SIGN and L-SIGN receptors in HIV-1 vertical transmission. Hum. Immunol. 72: 305—311. PMID 21277928 DOI:10.1016/j.humimm.2011.01.012

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13523 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.((cite web)): Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9H2X3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 січня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350