CSF1R

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2I0V, 2I0Y, 2I1M, 2OGV, 3BEA, 3DPK, 3KRJ, 3KRL, 3LCD, 3LCO, 4DKD, 4HW7, 4LIQ, 4R7H, 4R7I, 4WRL, 4WRM

Ідентифікатори

Символи

CSF1R, C-FMS, CD115, CSF-1R, CSFR, FIM2, FMS, HDLS, M-CSF-R, colony stimulating factor 1 receptor, BANDDOS, HDLS1

Зовнішні ІД

OMIM: 164770 MGI: 1339758 HomoloGene: 3817 GeneCards: CSF1R

шифр КФ

2.7.10.1

Пов'язані генетичні захворювання

Hereditary diffuse leukoencephalopathy with spheroids, adult-onset leukoencephalopathy with axonal spheroids and pigmented glia^[1]

Реагує на сполуку

cediranib, crenolanib, linifanib, Пазопаніб, Emactuzumab, enmd-981693^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • protein tyrosine kinase activity • protein kinase activity • transferase activity • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • kinase activity • protein homodimerization activity • ATP binding • protein phosphatase binding • macrophage colony-stimulating factor receptor activity • GO:0019974 cytokine binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • receptor tyrosine kinase • transmembrane signaling receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • cell surface • CSF1-CSF1R complex • нуклеоплазма • клітинна мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • цитоплазма • receptor complex
Біологічний процес	• negative regulation of cell population proliferation • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • positive regulation of protein serine/threonine kinase activity • mammary gland duct morphogenesis • positive regulation of cell motility • macrophage colony-stimulating factor signaling pathway • phosphatidylinositol-mediated signaling • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • GO:0072468 сигнальна трансдукція • axon guidance • multicellular organism development • monocyte differentiation • macrophage differentiation • ruffle organization • positive regulation of cell migration • cellular response to cytokine stimulus • protein autophosphorylation • peptidyl-tyrosine phosphorylation • olfactory bulb development • regulation of bone resorption • phosphatidylinositol metabolic process • protein phosphorylation • positive regulation of protein tyrosine kinase activity • cell-cell junction maintenance • osteoclast differentiation • вроджений імунітет • regulation of actin cytoskeleton reorganization • процес імунної системи • inflammatory response • positive regulation of protein phosphorylation • forebrain neuron differentiation • фосфорилювання • cellular response to macrophage colony-stimulating factor stimulus • positive regulation of cell population proliferation • regulation of cell shape • проліферація • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • cytokine-mediated signaling pathway • кровотворення • negative regulation of signal transduction • диференціація клітин • hematopoietic progenitor cell differentiation • positive regulation of MAPK cascade • response to ischemia • microglial cell proliferation • positive regulation by host of viral process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1436


12978

Ensembl


ENSG00000182578


ENSMUSG00000024621

UniProt


P07333


P09581

RefSeq (мРНК)


NM_001288705 NM_005211 NM_001349736 NM_001375320 NM_001375321


NM_001037859 NM_007779

RefSeq (білок)


NP_001275634 NP_005202 NP_001336665 NP_001362249 NP_001362250


NP_001032948

Локус (UCSC)

Хр. 5: 150.05 – 150.11 Mb

Хр. 18: 61.23 – 61.27 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CSF1R (англ. Colony stimulating factor 1 receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 972 амінокислот, а молекулярна маса — 107 984^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPGVLLLLL	VATAWHGQGI	PVIEPSVPEL	VVKPGATVTL	RCVGNGSVEW
DGPPSPHWTL	YSDGSSSILS	TNNATFQNTG	TYRCTEPGDP	LGGSAAIHLY
VKDPARPWNV	LAQEVVVFED	QDALLPCLLT	DPVLEAGVSL	VRVRGRPLMR
HTNYSFSPWH	GFTIHRAKFI	QSQDYQCSAL	MGGRKVMSIS	IRLKVQKVIP
GPPALTLVPA	ELVRIRGEAA	QIVCSASSVD	VNFDVFLQHN	NTKLAIPQQS
DFHNNRYQKV	LTLNLDQVDF	QHAGNYSCVA	SNVQGKHSTS	MFFRVVESAY
LNLSSEQNLI	QEVTVGEGLN	LKVMVEAYPG	LQGFNWTYLG	PFSDHQPEPK
LANATTKDTY	RHTFTLSLPR	LKPSEAGRYS	FLARNPGGWR	ALTFELTLRY
PPEVSVIWTF	INGSGTLLCA	ASGYPQPNVT	WLQCSGHTDR	CDEAQVLQVW
DDPYPEVLSQ	EPFHKVTVQS	LLTVETLEHN	QTYECRAHNS	VGSGSWAFIP
ISAGAHTHPP	DEFLFTPVVV	ACMSIMALLL	LLLLLLLYKY	KQKPKYQVRW
KIIESYEGNS	YTFIDPTQLP	YNEKWEFPRN	NLQFGKTLGA	GAFGKVVEAT
AFGLGKEDAV	LKVAVKMLKS	TAHADEKEAL	MSELKIMSHL	GQHENIVNLL
GACTHGGPVL	VITEYCCYGD	LLNFLRRKAE	AMLGPSLSPG	QDPEGGVDYK
NIHLEKKYVR	RDSGFSSQGV	DTYVEMRPVS	TSSNDSFSEQ	DLDKEDGRPL
ELRDLLHFSS	QVAQGMAFLA	SKNCIHRDVA	ARNVLLTNGH	VAKIGDFGLA
RDIMNDSNYI	VKGNARLPVK	WMAPESIFDC	VYTVQSDVWS	YGILLWEIFS
LGLNPYPGIL	VNSKFYKLVK	DGYQMAQPAF	APKNIYSIMQ	ACWALEPTHR
PTFQQICSFL	QEQAQEDRRE	RDYTNLPSSS	RSGGSGSSSS	ELEEESSSEH
LTCCEQGDIA	QPLLQPNNYQ	FC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Visvader J., Verma I.M. (1989). Differential transcription of exon 1 of the human c-fms gene in placental trophoblasts and monocytes. Mol. Cell. Biol. 9: 1336—1341. PMID 2524648 DOI:10.1128/MCB.9.3.1336
Browning P.J., Bunn H.F., Cline A., Shuman M., Nienhuis A.W. (1986). 'Replacement' of COOH-terminal truncation of v-fms with c-fms sequences markedly reduces transformation potential. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 7800—7804. PMID 3532121 DOI:10.1073/pnas.83.20.7800
Morley G.M., Uden M., Gullick W.J., Dibb N.J. (1999). Cell specific transformation by c-fms activating loop mutations is attributable to constitutive receptor degradation. Oncogene. 18: 3076—3084. PMID 10340379 DOI:10.1038/sj.onc.1202646
Taylor J.R., Brownlow N., Domin J., Dibb N.J. (2006). FMS receptor for M-CSF (CSF-1) is sensitive to the kinase inhibitor imatinib and mutation of Asp-802 to Val confers resistance. Oncogene. 25: 147—151. PMID 16170366 DOI:10.1038/sj.onc.1209007
Hiraga T., Nakamura H. (2009). Imatinib mesylate suppresses bone metastases of breast cancer by inhibiting osteoclasts through the blockade of c-Fms signals. Int. J. Cancer. 124: 215—222. PMID 18814279 DOI:10.1002/ijc.23903

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CSF1R переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Colony stimulating factor 1 receptor переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2433 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 31 серпня 2017.
↑ UniProt, P07333 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350