CD6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5A2E

Ідентифікатори

Символи

CD6, TP120, CD6 molecule

Зовнішні ІД

OMIM: 186720 MGI: 103566 HomoloGene: 4893 GeneCards: CD6

Пов'язані генетичні захворювання

розсіяний склероз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipopolysaccharide binding • lipoteichoic acid binding • scavenger receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • T cell receptor complex • extracellular region • immunological synapse • external side of plasma membrane
Біологічний процес	• positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • acute inflammatory response to antigenic stimulus • рецептор-опосередкований ендоцитоз • response to lipopolysaccharide • адгезія клітин • positive regulation of T cell proliferation • вроджений імунітет • immunological synapse formation • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • vesicle-mediated transport • ендоцитоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


923


12511

Ensembl


ENSG00000013725


ENSMUSG00000024670

UniProt


P30203


Q61003

RefSeq (мРНК)


NM_001254750 NM_001254751 NM_006725


NM_001037801 NM_009852

RefSeq (білок)


NP_001241679 NP_001241680 NP_006716


NP_001032890 NP_033982

Локус (UCSC)

Хр. 11: 60.97 – 61.02 Mb

Хр. 19: 10.77 – 10.81 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CD6 (англ. CD6 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 668 амінокислот, а молекулярна маса — 71 801^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWLFFGITGL	LTAALSGHPS	PAPPDQLNTS	SAESELWEPG	ERLPVRLTNG
SSSCSGTVEV	RLEASWEPAC	GALWDSRAAE	AVCRALGCGG	AEAASQLAPP
TPELPPPPAA	GNTSVAANAT	LAGAPALLCS	GAEWRLCEVV	EHACRSDGRR
ARVTCAENRA	LRLVDGGGAC	AGRVEMLEHG	EWGSVCDDTW	DLEDAHVVCR
QLGCGWAVQA	LPGLHFTPGR	GPIHRDQVNC	SGAEAYLWDC	PGLPGQHYCG
HKEDAGAVCS	EHQSWRLTGG	ADRCEGQVEV	HFRGVWNTVC	DSEWYPSEAK
VLCQSLGCGT	AVERPKGLPH	SLSGRMYYSC	NGEELTLSNC	SWRFNNSNLC
SQSLAARVLC	SASRSLHNLS	TPEVPASVQT	VTIESSVTVK	IENKESRELM
LLIPSIVLGI	LLLGSLIFIA	FILLRIKGKY	ALPVMVNHQH	LPTTIPAGSN
SYQPVPITIP	KEVFMLPIQV	QAPPPEDSDS	GSDSDYEHYD	FSAQPPVALT
TFYNSQRHRV	TDEEVQQSRF	QMPPLEEGLE	ELHASHIPTA	NPGHCITDPP
SLGPQYHPRS	NSESSTSSGE	DYCNSPKSKL	PPWNPQVFSS	ERSSFLEQPP
NLELAGTQPA	FSAGPPADDS	SSTSSGEWYQ	NFQPPPQPPS	EEQFGCPGSP
SPQPDSTDND	DYDDISAA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]

Aruffo A., Melnick M.B., Linsley P.S., Seed B. (1991). The lymphocyte glycoprotein CD6 contains a repeated domain structure characteristic of a new family of cell surface and secreted proteins. J. Exp. Med. 174: 949—952. PMID 1919444 DOI:10.1084/jem.174.4.949
Hassan N.J., Barclay A.N., Brown M.H. (2004). Frontline: Optimal T cell activation requires the engagement of CD6 and CD166. Eur. J. Immunol. 34: 930—940. PMID 15048703 DOI:10.1002/eji.200424856
Swack J.A., Mier J.W., Romain P.L., Hull S.R., Rudd C.E. (1991). Biosynthesis and post-translational modification of CD6, a T cell signal-transducing molecule. J. Biol. Chem. 266: 7137—7143. PMID 2016320

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CD6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1691 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.((cite web)): Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P30203 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350