ALCAM

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5A2F

Ідентифікатори

Символи

ALCAM, CD166, MEMD, activated leukocyte cell adhesion molecule

Зовнішні ІД

OMIM: 601662 MGI: 1313266 HomoloGene: 1229 GeneCards: ALCAM

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • cell projection • мембрана • focal adhesion • intrinsic component of plasma membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • T cell receptor complex • extracellular region • аксон • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • immunological synapse • екзосома • external side of plasma membrane
Біологічний процес	• heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • neuron projection extension • адгезія клітин • motor neuron axon guidance • axon extension involved in axon guidance • GO:0072468 сигнальна трансдукція • retinal ganglion cell axon guidance • axon guidance
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


214


11658

Ensembl


ENSG00000170017


ENSMUSG00000022636

UniProt


Q13740


Q61490

RefSeq (мРНК)


NM_001627 NM_001243280 NM_001243281 NM_001243283


NM_009655 NM_001331110

RefSeq (білок)


NP_001230209 NP_001230210 NP_001230212 NP_001618


NP_001318039 NP_033785

Локус (UCSC)

Хр. 3: 105.37 – 105.58 Mb

Хр. 16: 52.07 – 52.27 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ALCAM (англ. Activated leukocyte cell adhesion molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 583 амінокислот, а молекулярна маса — 65 102^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESKGASSCR	LLFCLLISAT	VFRPGLGWYT	VNSAYGDTII	IPCRLDVPQN
LMFGKWKYEK	PDGSPVFIAF	RSSTKKSVQY	DDVPEYKDRL	NLSENYTLSI
SNARISDEKR	FVCMLVTEDN	VFEAPTIVKV	FKQPSKPEIV	SKALFLETEQ
LKKLGDCISE	DSYPDGNITW	YRNGKVLHPL	EGAVVIIFKK	EMDPVTQLYT
MTSTLEYKTT	KADIQMPFTC	SVTYYGPSGQ	KTIHSEQAVF	DIYYPTEQVT
IQVLPPKNAI	KEGDNITLKC	LGNGNPPPEE	FLFYLPGQPE	GIRSSNTYTL
TDVRRNATGD	YKCSLIDKKS	MIASTAITVH	YLDLSLNPSG	EVTRQIGDAL
PVSCTISASR	NATVVWMKDN	IRLRSSPSFS	SLHYQDAGNY	VCETALQEVE
GLKKRESLTL	IVEGKPQIKM	TKKTDPSGLS	KTIICHVEGF	PKPAIQWTIT
GSGSVINQTE	ESPYINGRYY	SKIIISPEEN	VTLTCTAENQ	LERTVNSLNV
SAISIPEHDE	ADEISDENRE	KVNDQAKLIV	GIVVGLLLAA	LVAGVVYWLY
MKKSKTASKH	VNKDLGNMEE	NKKLEENNHK	TEA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]

Ikeda K., Quertermous T. (2004). Molecular isolation and characterization of a soluble isoform of activated leukocyte cell adhesion molecule that modulates endothelial cell function. J. Biol. Chem. 279: 55315—55323. PMID 15496415 DOI:10.1074/jbc.M407776200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Skonier J.E., Bowen M.A., Emswiler J., Aruffo A., Bajorath J. (1996). Recognition of diverse proteins by members of the immunoglobulin superfamily: delineation of the receptor binding site in the human CD6 ligand ALCAM. Biochemistry. 35: 12287—12291. PMID 8823162 DOI:10.1021/bi961038k
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
Hassan N.J., Barclay A.N., Brown M.H. (2004). Frontline: Optimal T cell activation requires the engagement of CD6 and CD166. Eur. J. Immunol. 34: 930—940. PMID 15048703 DOI:10.1002/eji.200424856
Bajorath J., Bowen M.A., Aruffo A. (1995). Molecular model of the N-terminal receptor-binding domain of the human CD6 ligand ALCAM. Protein Sci. 4: 1644—1647. PMID 8520490 DOI:10.1002/pro.5560040822

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:400 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.((cite web)): Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13740 (англ.) . Архів оригіналу за 27 листопада 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фібрилярні білки

Позаклітинний матрикс

Колаген

Фібрилотворчі	тип І COL1A1 COL1A2 тип ІІ (COL2A1) тип ІІІ COL3A1 тип V COL5A1 COL5A2 COL5A3 COL24A1 COL26A1
Інші	FACIT: тип IX COL9A1 COL9A2 COL9A3 тип XII (COL12A1) COL14A1 COL16A1 COL19A1 COL20A1 COL21A1 COL22A1 базальна мембрана: тип IV COL4A1 COL4A2 COL4A3 COL4A4 COL4A5 COL4A6 мультиплексин: COL15A1 тип XVIII COL18A1 Ендостатин трансмембрана: COL13A1 COL17A1 COL23A1 COL25A1 інші: тип VI COL6A1 COL6A2 COL6A3 COL6A5 тип VII COL7A1 тип VIII COL8A1 COL8A2 тип X (COL10A1) тип XI COL11A1 COL11A2 COL27A1 COL28A1
Ензими	Пролілгідроксилаза/Лізилгідроксилаза CRTAP/Лепрекан ADAMTS2 Проколаген пептидаза Лізилоксидаза

Ламінін

альфа
- LAMA1
- LAMA2
- LAMA3
- LAMA4
- LAMA5
бета
- LAMB1
- LAMB2
- LAMB3
- LAMB4
гамма
- LAMC1
- LAMC2
- LAMC3

Інші

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350