CDH1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CDH1, Arc-1, CD324, CDHE, ECAD, LCAM, UVO, cadherin 1, BCDS1, E-cadherin, uvomorulin
Зовнішні ІД OMIM: 192090 MGI: 88354 HomoloGene: 20917 GeneCards: CDH1
Пов'язані генетичні захворювання
колоректальний рак, Blepharo-cheilo-odontic syndrome, hereditary diffuse gastric cancer[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_004360
NM_001317184
NM_001317185
NM_001317186
NM_009864
RefSeq (білок)
NP_001304113
NP_001304114
NP_001304115
NP_004351
NP_033994
Локус (UCSC) Хр. 16: 68.74 – 68.84 Mb Хр. 8: 107.33 – 107.4 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CDH1 (англ. Cadherin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 882 амінокислот, а молекулярна маса — 97 456[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGR
VLGRVNFEDCTGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLV
YAWDSTYRKFSTKVTLNTVGHHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLR
RQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTP
PVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGNAVEDPMEILI
TVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAI
AYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAADL
QGEGLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTD
ADAPNTPAWEAVYTILNDDGGQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQY
ILHVAVTNVVPFEVSLTTSTATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFG
VGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDR
EDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVNDNAPIPEPRTI
FFCERNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASANWTIQYNDPTQESI
ILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKDQVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQP
VEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRD
NVYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPEVTRNDVAPTLMSVPRYLPR
PANPDEIGNFIDENLKAADTDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSEAASLSSLNS
SESDKDQDYDYLNEWGNRFKKLADMYGGGEDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

[ред. | ред. код]

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з CDH1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1748 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, P12830 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.
  Портал «Біологія»   Портал «Хімія»