IFNGR1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1FG9, 1FYH, 1JRH

Ідентифікатори

Символи

IFNGR1, CD119, IFNGR, IMD27A, IMD27B, interferon gamma receptor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 107470 MGI: 107655 HomoloGene: 359 GeneCards: IFNGR1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• interferon-gamma receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0019974 cytokine binding • GO:0016518 cytokine receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинна мембрана
Біологічний процес	• response to virus • regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • interferon-gamma-mediated signaling pathway • cytokine-mediated signaling pathway • microglial cell activation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • astrocyte activation • negative regulation of amyloid-beta clearance • positive regulation of amyloid-beta formation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3459


15979

Ensembl


ENSG00000027697


ENSMUSG00000020009

UniProt


P15260


P15261

RefSeq (мРНК)


NM_000416 NM_001363526 NM_001363527


NM_010511

RefSeq (білок)


NP_000407 NP_001350455 NP_001350456


NP_034641

Локус (UCSC)

Хр. 6: 137.2 – 137.22 Mb

Хр. 10: 19.47 – 19.49 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

IFNGR1 (англ. Interferon gamma receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 489 амінокислот, а молекулярна маса — 54 405^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALLFLLPLV	MQGVSRAEMG	TADLGPSSVP	TPTNVTIESY	NMNPIVYWEY
QIMPQVPVFT	VEVKNYGVKN	SEWIDACINI	SHHYCNISDH	VGDPSNSLWV
RVKARVGQKE	SAYAKSEEFA	VCRDGKIGPP	KLDIRKEEKQ	IMIDIFHPSV
FVNGDEQEVD	YDPETTCYIR	VYNVYVRMNG	SEIQYKILTQ	KEDDCDEIQC
QLAIPVSSLN	SQYCVSAEGV	LHVWGVTTEK	SKEVCITIFN	SSIKGSLWIP
VVAALLLFLV	LSLVFICFYI	KKINPLKEKS	IILPKSLISV	VRSATLETKP
ESKYVSLITS	YQPFSLEKEV	VCEEPLSPAT	VPGMHTEDNP	GKVEHTEELS
SITEVVTTEE	NIPDVVPGSH	LTPIERESSS	PLSSNQSEPG	SIALNSYHSR
NCSESDHSRN	GFDTDSSCLE	SHSSLSDSEF	PPNNKGEIKT	EGQELITVIK
APTSFGYDKP	HVLVDLLVDD	SGKESLIGYR	PTEDSKEFS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

[ред. | ред. код]

Aguet M., Dembic Z., Merlin G. (1988). Molecular cloning and expression of the human interferon-gamma receptor. Cell. 55: 273—280. PMID 2971451 DOI:10.1016/0092-8674(88)90050-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Stueber D., Friedlein A., Fountoulakis M., Lahm H.-W., Garotta G. (1993). Alignment of disulfide bonds of the extracellular domain of the interferon gamma receptor and investigation of their role in biological activity. Biochemistry. 32: 2423—2430. PMID 8443182 DOI:10.1021/bi00060a038
Thye T., Burchard G.D., Nilius M., Mueller-Myhsok B., Horstmann R.D. (2003). Genomewide linkage analysis identifies polymorphism in the human interferon-gamma receptor affecting Helicobacter pylori infection. Am. J. Hum. Genet. 72: 448—453. PMID 12516030 DOI:10.1086/367714

Примітки

[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5439 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P15260 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350