Serinska proteaza | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikatori | |||||||||
EC broj | 3.4.21.- | ||||||||
Baze podataka | |||||||||
IntEnz | IntEnz pregled | ||||||||
BRENDA | BRENDA pristup | ||||||||
ExPASy | NiceZyme pregled | ||||||||
KEGG | KEGG pristup | ||||||||
MetaCyc | metabolički put | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
Strukture PBP | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum | ||||||||
|
Serinske proteaze (ili serinske endopeptidaze) enzimi su koji presecaju peptidne veze proteina, i u kojima serin služi kao nukleofilna aminokiselina na aktivnom mestu enzima.[1]
One su sveprisutne kod eukariota i prokariota. Serinske proteaze se dele u dve široke kategorije na osnovu njihove strukture: himotripsin slične (tripsinu slične) ili subtilisinu slične.[2] Kod ljudi, one su odgovorne za koordiniranje različitih fizioloških funkcija, uključujući varenje, imunski respons, koagulaciju krvi i reprodukciju.[1]
MEROPS proteazni klasifikacioni sistem sadrži 16 superfamilija (2013) svaka od kojih sadrži mnoštvo familija. Svaka superfamilija koristi katalitičku trijadu ili dijadu u različitim proteinskim savijanjima, što je primer konvergentne evolucije katalitičkog mehanizma. Većina enzima pripada S1 familiji PA klana (superfamilije) proteaza.
P superfamilija sadrži mešavinu nukleofilnih klasa familija, dok se S sastoji od serinskih proteaza. Unutar svake superfamilije, familije su označene po njihovim katalitičkim nukleofilu (S = serinske proteaze).
Familije serinskih proteaza
Superfamilija | Familije | Primeri |
---|---|---|
SB | S8, S53 | Subtilisin (Bacillus licheniformis) |
SC | S9, S10, S15, S28, S33, S37 | Prolilna oligopeptidaza (Sus scrofa) |
SE | S11, S12, S13 | D-Ala-D-Ala peptidaza C (Escherichia coli) |
SF | S24, S26 | Signalna peptidaza I (Escherichia coli) |
SH | S21, S73, S77, S78, S80 | Citomegalovirus asemblin (ljudski herpesvirus 5) |
SJ | S16, S50, S69 | Lon-A peptidaza (Escherichia coli) |
SK | S14, S41, S49 | Clp proteaza (Escherichia coli) |
SO | S74 | Fag K1F endosijalidaza CIMCD samo-rascepljujući protein (Enterobacterija fag K1F) |
SP | S59 | Nukleoporin 145 (Homo sapiens) |
SR | S60 | Laktoferin (Homo sapiens) |
SS | S66 | Mureinska tetrapeptidaza LD-karboksipeptidaza (Pseudomonas aeruginosa) |
ST | S54 | Romboid-1 (Drosophila melanogaster) |
PA | S1, S3, S6, S7, S29, S30, S31, S32, S39, S46, S55, S64, S65, S75 | Himotripsin A (Bos taurus) |
PB | S45, S63 | prekursor penicilin G acilaze (Escherichia coli) |
PC | S51 | Dipeptidaza E (Escherichia coli) |
PE | P1 | DmpA aminopeptidaza (Ochrobactrum anthropi) |
unassigned | S48, S62, S68, S71, S72, S79, S81 |