Varian Kappa SARS-CoV-2, juga dikenal sebagai garis keturunan B.1.617.1, adalah varian dari garis keturunan B.1.617 dari SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan Covid-19.[1] Varian ini termasuk varian yang dianggap penting. Ia ditemukan di India pada Desember 2020.[2]
Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) melabeli varian ini sebagai varian Kappa bukan untuk menggantikan nama ilmiah, melainkan sebagai nama yang dipakai secara umum di ruang publik.[3] WHO menganggapnya sebagai varian yang butuh perhatian (variant of interest).
Gejala yang sering muncul adalah ruam di sekujur tubuh, demam tinggi, batuk, pilek, serta mata merah dan berair.[4][5]
Gen | Nukleotida | Asam amino |
---|---|---|
ORF1a | C4965T | T1567I |
A11201G | T3646A | |
ORF1b | P314L | |
G1129C | ||
G17523T | M1352I | |
A20396G | K2310R | |
S2312A | ||
Bulir | G22022A | E154K |
T22917G | L452R | |
G23012C | E484Q | |
D614G | ||
C23604G | P681R | |
Q1071H | ||
ORF3a | C25469T | S26L |
M | I82S | |
ORF7a | T27638C | V82A |
N | G28881T | R203M |
D377Y | ||
Sumber: CoVariants,[6] PHE[7] | ||
Catatan: N501Y berarti perubahan dari asparagina (N) menjadi tirosina (Y) pada posisi asam amino 501.[8] |
Mutasi pada SARS-CoV-2 cukup sering: lebih dari empat ribu mutasi telah dideteksi hanya pada bulir proteinnya menurut Konsorsium Britania Raya untuk Genom COVID-19.[9]
Varian ini terdiri dari 25 mutasi: 18 mutasi tak bersinonim dan 7 mutasi bersinonim (salah satunya mutasi hapus),[6] yaitu 18 mutasi yang mengubah protein dan 7 mutasi yang tidak berdampak.[10]
Mutasi L452R menguatkan afinitas protein bulir terhadap reseptor ACE2 sehingga mengurangi kemampuan sistem kekebalan tubuh untuk mengenalinya.[11][12] Mutasi E484Q menguatkan potensi terikat dengan ACE2 dan meningkatkan kemampuan menghindar dari sistem kekebalan tubuh.[13][14]
Kasus menurut negara (Diperbarui per 7 Juli 2021) GISAID[15] | ||
---|---|---|
Negara | Kasus yang dikonfirmasi | Tanggal koleksi |
India | 3,693 | 26 Mei 2021 |
Britania Raya | 517 | 31 Mei 2021 |
AS | 299 | 24 Juni 2021 |
Kanada | 266 | 12 Mei 2021 |
Irlandia | 170 | 8 Juni 2021 |
Australia | 112 | 15 Juni 2021 |
Jerman | 106 | 22 Juni 2021 |
Singapura | 59 | 13 Mei 2021 |
Denmark | 28 | 31 Mei 2021 |
Belanda | 27 | 12 Juni 2021 |
Jepang | 27 | 7 Mei 2021 |
Angola | 24 | 20 April 2021 |
Prancis | 16 | 20 Mei 2021 |
Belgia | 16 | 13 Mei 2021 |
Cina | 13 | 18 April 2021 |
Qatar | 12 | 17 Mei 2021 |
Korea Selatan | 12 | 27 April 2021 |
Swiss | 10 | 4 Mei 2021 |
Portugal | 9 | 4 Mei 2021 |
Italia | 9 | 24 Mei 2021 |
Bahrain | 8 | 10 April 2021 |
Meksiko | 8 | 2 Juni 2021 |
Afrika Selatan | 8 | 18 Juni 2021 |
Finlandia | 7 | 23 Mei 2021 |
Luksemburg | 6 | 26 April 2021 |
Spanyol | 5 | 19 Mei 2021 |
Swedia | 5 | 17 April 2021 |
Ghana | 5 | 20 April 2021 |
Kenya | 5 | 29 April 2021 |
Republik Ceko | 4 | 4 Mei 2021 |
Yordania | 4 | 25 April 2021 |
Myanmar | 4 | 2 Juni 2021 |
Selandia Baru | 4 | 8 April 2021 |
Malaysia | 4 | 1 Juni 2021 |
Indonesia | 3 | 29 April 2021 |
Guadeloupe | 2 | 10 Maret 2021 |
Malawi | 2 | 30 April 2021 |
Nepal | 2 | 9 Mei 2021 |
Sint Maarten | 2 | 3 April 2021 |
Botswana | 2 | 1 Juni 2021 |
Kuwait | 1 | |
Austria | 1 | |
Kamboja | 1 | 5 April 2021 |
Curaçao | 1 | 23 April 2021 |
Yunani | 1 | 6 April 2021 |
Slovakia | 1 | 19 April 2021 |
Slovenia | 1 | 6 April 2021 |
Thailand | 1 | 26 April 2021 |
Uganda | 1 | 26 Maret 2021 |
Zambia | 1 | 2 Mei 2021 |
Dunia (50 negara) | Jumlah: 5,525 | Total per 1 Juli 2021 |
Pada 1 Juli 2021, varian ini ditemukan di Indonesia.[16][17]
For example, recently detected viruses of lineage B.1.617.1 were anticipated to show altered antigenicity due to the presence of the substitutions L452R and E484Q, which have been described as affecting antibody recognition.
| |||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||