TACK

Sulfolobus
Clasificación científica
Dominio: Archaea
Reino: Proteoarchaeota
Superfilo: grupo TACK
Guy & Ettema 2011
Phyla[1]
Sinonimia
  • Crenarchaeota Garrity & Holt 2002
  • "Eocyta" Lake et al. 1984[2][3]
  • "Filarchaeota" Cavalier-Smith 2014

TACK é o nome dun grupo de arqueas, que é un acrónimo de Thaumarchaeota (agora Nitrososphaerota), Aigarchaeota, Crenarchaeota (agora Thermoproteota) e Korarchaeota, os primeiros grupos descubertos. Encóntranse en ambientes diferentes que van desde termófilos acidófilos a mesófilos e psicrófilos e con diferentes tipos de metabolismo, predominantemente anaerobios e quimiosintéticos.[4] TACK é un clado que é irmán da rama Asgard que deu lugar aos eucariotas. Propúxose que o clado TACK se clasificase como Crenarchaeota e que as "Crenarchaeota" (Thermoproteota) tradicionais fosen clasificadas como unha clase chamada "Sulfolobia", xunto cos outros filos con rango de clase ou orde.[5]

Clasificación

Filoxenia

As relacións son aproximadamente as seguintes:

McKay et al. 2019[6] LTP_06_2022 baseada no ARNr 16S[7][8][9] GTDB 08-RS214 baseado en 53 proteínas marcadoras[10][11][12]
"TACK"

"Korarchaeota"

"Bathyarchaeota"

"Aigarchaeota"

Nitrososphaerota

"Verstraetearchaeota"

Thermoproteota

"Geoarchaeota"

"Marsarchaeota"

"TACK"
Nitrososphaerota
Conexivisphaeria

Conexivisphaerales

Nitrososphaeria

Nitrososphaerales

Nitrosopumilales

Thermoproteota
Thermoproteia

Thermoproteales

Fervidicoccales

Desulfurococcales 2

Desulfurococcales

Sulfolobales

"TACK"
"Korarchaeia"

"Korarchaeales"

"BAT"

"Bathyarchaeia" (MCG)

Nitrososphaeria_A

"Caldarchaeales"

("Aigarchaeota")
Nitrososphaeria

"Geothermarchaeales"

Conexivisphaerales

Nitrososphaerales
(Thaumarchaeota)

"Sulfobacteria"
"Methanomethylicia"

"Methanomethylicales"

"Nezhaarchaeales"

("Verstraetearchaeota")
"Thermoproteia"

"Gearchaeales"

"Thermofilales"

Thermoproteales

"Sulfolobia"

"Marsarchaeales"

Sulfolobales

Thermoproteota
Hipótese do eocito[13]

Hipótese do eocito

Véxase tamén: Eucarioxénese.

A hipótese do eocito, proposta na década de 1980 por James Lake, suxire que os eucariotas xurdiron dentro dos eocitos procarióoticos.[14]

Unha proba que apoia a relación estreita entre TACK e os eucariotas é a presenza dun homólogo da subunidade Rbp-8 da ARN polimerase en Thermoproteota pero non en Euryarchaea.[15]

Notas

  1. Castelle, C.J.; Banfield, J.F. (2018). "Major New Microbial Groups Expand Diversity and Alter our Understanding of the Tree of Life". Cell 172 (6): 1181–1197. PMID 29522741. doi:10.1016/j.cell.2018.02.016. 
  2. Lake, J.A.; Henderson, E.; Oakes, M. (Clark, M.W.) (1984). "Eocytes: A new ribosome structure indicates a kingdom with a close relationship to eukaryotes". PNAS 81 (12): 3786–3790. Bibcode:1984PNAS...81.3786L. PMC 345305. PMID 6587394. doi:10.1073/pnas.81.12.3786. 
  3. Lake, J.A. (2015). "Eukaryotic origins". Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 370 (1678): 20140321. PMC 4571561. PMID 26323753. doi:10.1098/rstb.2014.0321. 
  4. Guy, Lionel; Ettema, Thijs J.G. (2011). "The archaeal 'TACK' superphylum and the origin of eukaryotes". Trends in Microbiology 19 (12): 580–587. PMID 22018741. doi:10.1016/j.tim.2011.09.002. 
  5. Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E-Yung (2020). "Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (Eukaryotes, archaebacteria)". Protoplasma 257 (3): 621–753. PMC 7203096. PMID 31900730. doi:10.1007/s00709-019-01442-7. 
  6. McKay, L.J., Dlakić, M., Fields, M.W. et al. Co-occurring genomic capacity for anaerobic methane and dissimilatory sulfur metabolisms discovered in the Korarchaeota. Nat Microbiol 4, 614–622 (2019) doi:10.1038/s41564-019-0362-4
  7. "The LTP". The All-Species Living Tree Project. Consultado o 10 May 2023. 
  8. "LTP_all tree in newick format". The All-Species Living Tree Project. Consultado o 10 May 2023. 
  9. "LTP_06_2022 Release Notes" (PDF). The All-Species Living Tree Project. Consultado o 10 May 2023. 
  10. "GTDB release 08-RS214". Genome Taxonomy Database. Consultado o 10 May 2023. 
  11. "ar53_r214.sp_label". Genome Taxonomy Database. Consultado o 10 de maio de 2023. 
  12. "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Consultado o 10 de maio de 2023. 
  13. Cox, C. J.; Foster, P. G.; Hirt, R. P.; Harris, S. R.; Embley, T. M. (2008). "The archaebacterial origin of eukaryotes". Proc Natl Acad Sci USA 105 (51): 20356–61. Bibcode:2008PNAS..10520356C. PMC 2629343. PMID 19073919. doi:10.1073/pnas.0810647105. 
  14. (UCLA) The origin of the nucleus and the tree of life Arquivado 2003-02-07 en Archive.is
  15. Kwapisz, M.; Beckouët, F.; Thuriaux, P. (2008). "Early evolution of eukaryotic DNA-dependent RNA polymerases". Trends Genet. 24 (5): 211–5. PMID 18384908. doi:10.1016/j.tig.2008.02.002.