Przykład ortogonalnie zabezpieczonego monomeru stosowanego w syntezie oligonukleotydów. Na niebiesko oznaczono kwasolabilną grupę dimetoksytrytylową (DMTr), na czerwono zasadolabilną grupę 2-cyjanoetylową (CE), na zielono grupę tert-butylodimetylosililową (TBDMS) usuwaną fluorkami

Grupy ochronne (również: blokujące, protekcyjne, zabezpieczające) – rodzaj ugrupowań chemicznych tymczasowo przyłączanych do wybranych grup funkcyjnych związku wielofunkcyjnego w celu zapobiegania ich dalszym przekształceniom w toku syntezy organicznej[1][2]. O przydatności danej grupy ochronnej decyduje spełnienie następujących warunków[1]:

Wykorzystanie grupy ochronnej w toku syntezy dodaje przynajmniej dwa dodatkowe etapy do zaplanowanego ciągu syntetycznego – etap protekcji (zabezpieczania), w którym wybrane ugrupowanie jest dołączane do danej grupy funkcyjnej związku, blokując możliwość ulegania dalszym reakcjom, oraz etap deprotekcji (odbezpieczania), w którym grupa ochronna jest usuwana, przywracając daną grupę funkcyjną do pierwotnej postaci[3].

Rodzaje grup ochronnych

Grupy stosowane do protekcji alkoholi i fenoli

Najpopularniejsze metody zabezpieczania grup hydroksylowych wykorzystują ich przekształcenie w etery, acetale, ketale bądź estry[3].

Struktury wybranych grup ochronnych stosowanych do protekcji alkoholi

Wybrane przykłady grup ochronnych alkoholi:

Etery

Estry

Estrowe grupy ochronne wprowadzane są w reakcji alkoholi z odpowiednimi chlorkami lub bezwodnikami kwasowymi. Usuwane są przez hydrolizę w środowisku zasadowym. Ich trwałość rośnie wraz z zawadą przestrzenną: Pv > Bz > Ac[10]. Przykłady:

Grupy stosowane do protekcji amin

Struktury wybranych grup ochronnych stosowanych do protekcji amin

Wiele grup ochronnych alkoholi może być również wykorzystane do zabezpieczania grup aminowych, np. grupa acetylowa (Ac), benzylowa (Bn), benzoilowa (Bz)[3]. Pozostałe grupy ochronne amin:

Grupy stosowane do protekcji kwasów karboksylowych

Zabezpieczanie grupy karboksylowej najczęściej odbywa się poprzez przekształcenie jej w grupę estrową, tworząc następujące ugrupowania[3]:

Protekcja pozostałych grup funkcyjnych

Grupy karbonylowe są najczęściej blokowane z utworzeniem acetali i ketali[3]. 1,2-Diole mogą zostać zabezpieczone poprzez utworzenie cyklicznego ketalu. Usunięcie takiego rodzaju protekcji zachodzi pod wpływem kwasu[19].

Grupa fosforanowa może być zabezpieczona za pomocą grupy 2-cyjanoetylowej, co jest często wykorzystywane w syntezie oligonukleotydów[7][20].

Ortogonalność grup ochronnych

Grupy protekcyjne, których usunięcie zachodzi w odmiennych warunkach (niezależnie od siebie), nazywa się ortogonalnymi grupami ochronnymi[21].

Przypisy

  1. a b Kocienski 2005 ↓, Death, Taxes, and Protecting Groups, s. 2.
  2. Michael Schelhaas, Herbert Waldmann, Protecting Group Strategies in Organic Synthesis, „Angewandte Chemie International Edition in English”, 35 (18), 1996, s. 2056–2083, DOI10.1002/anie.199620561 (ang.).
  3. a b c d e f g Jacek Skarżewski, Wprowadzenie do syntezy organicznej, Warszawa–Łódź: Wydawictwo Naukowe PWN, 1999, s. 114–128, ISBN 83-01-12948-4, OCLC 749296768.
  4. Kocienski 2005 ↓, Methyl Ethers, s. 230–237.
  5. Kocienski 2005 ↓, Benzyl Ethers (Bn), s. 241–257.
  6. Kocienski 2005 ↓, Trityl (Tr) Ethers, s. 269–275.
  7. a b Sudhir Agrawal (red.), Protocols for Oligonucleotides and Analogs, New Jersey: Humana Press, 1993 (seria Methods in Molecular Biology, t. 20), DOI10.1385/0896032817, ISBN 978-0-89603-281-1, OCLC 55638684 (ang.).
  8. Kocienski 2005 ↓, Methoxymethyl (MOM) Ethers, s. 286–295.
  9. Kocienski 2005 ↓, Protecting Groups Cleaved by Fluoride Ions, s. 7.
  10. Kocienski 2005 ↓, Acetate Esters (Ac), s. 323–325.
  11. Kocienski 2005 ↓, Acetate Esters (Ac), s. 325–330.
  12. Kocienski 2005 ↓, Benzoate Esters (Bz), s. 330–331.
  13. Kocienski 2005 ↓, Pivalate Esters (Pv), s. 331–333.
  14. Kocienski 2005 ↓, Benzyloxycarbonyl (Z or Cbz), s. 512–524.
  15. Kocienski 2005 ↓, tert-Butoxycarbonyl (Boc), s. 505–512.
  16. Kocienski 2005 ↓, 9-Fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), s. 528–534.
  17. Kocienski 2005 ↓, Arylsulfonyl Derivatives, s. 543–554.
  18. Kocienski 2005 ↓, Phthaloyl (Phth) and Tetrachlorophthaloyl (TCP), s. 488–495.
  19. Kocienski 2005 ↓, Acetals, s. 120–160.
  20. Álvaro Somoza, Protecting groups for RNA synthesis: an increasing need for selective preparative methods, „Chemical Society Reviews”, 37 (12), 2008, s. 2668, DOI10.1039/b809851d (ang.).
  21. Protective Groups [online], Organic Chemistry Portal [dostęp 2022-05-09] (ang.).

Bibliografia