Mutagen er ein eigenskap ved eit stoff eller annan faktor som gjer at det kan framkalla (indusera) mutasjonar.[1] Denne evna blir sett på som eit teikna på at stoffet er giftig for organismar, og er medverkande til å fastlegga grenseverdiane ein set for stoffa. Ein kan nytta mutagen til å forårsaka mutasjonar på kunstig viss, såkalla mutagenese.[2]