Az A-, B- és Z-DNS felül- és oldalnézetből

A B-DNS a dezoxiribonukleinsav egyik lehetséges kettőshélix-szerkezete.[1]

Jellemzői

A B-DNS jobbra forduló kétszálú DNS-szerkezet, mely az A-DNS-nél lazább, nukleobázisai a hélixtengelyre merőlegesek. A B-DNS a fiziológiás körülmények közt legjellemzőbb DNS-szerkezet, például a sejtek kromoszómáiban is így van jelen a DNS.[2] További DNS-szerkezetek például az A-DNS, a Z-DNS, a hajtű-, a triplex, a kereszt alakú, a balra forgató Z, a tetraplex és az A-motívum.[3] A lazább forma miatt a B-DNS-ben az A-DNS-nél kevesebb nukleobázis van fordulatonként, a nagy mélyedés sekélyebb, a kicsi mélyebb, és fordulatonként 30%-kal hosszabb.[4]

Kétszálú DNS-szerkezetek (dsDNS)

B-DNS
A hélixtengely helyzete G-C bázispárhoz képest az A-, a B- és a Z-DNS-ben
Bázispárszerkezetek
Geometria A-DNS B-DNS Z-DNS
Hélixállás jobbra forgat jobbra forgat balra forgat
Ismétlődő egység 1 bázispár 1 bázispár 2 bázispár
Forgás/bázispár 32,7° 34,3° 60°/2
Átlagos bp/fordulat 11 10 12
Bázispár-inklináció +19° −1,2° −9°
Tengelymenti emelkedés/bp 2,6 Å (0,26 nm) 3,4 Å (0,34 nm) 3,7 Å (0,37 nm)
Fordulatonkénti emelkedés 28,6 Å (2,86 nm) 35,7 Å (3,57 nm) 45,6 Å (4,56 nm)
Átlagos csavarodás +18° +16°
Glikozilszög anti anti pirimidin: anti,

purin: szin

Nukleotidok foszfát-foszfát távolsága 5,9 Å 7,0 Å C: 5,7 Å, G: 6,1 Å
Cukorhelyzet C3'-endo C2'-endo C: C2'-endo, G: C3'-endo
Átmérő 23 Å (2,3 nm) 20 Å (2,0 nm) 18 Å (1,8 nm)

Jegyzetek

  1. D. L. Beveridge, T. E. Cheatham, M. Mezei (2012. július). „The ABCs of molecular dynamics simulations on B-DNA, circa 2012”. Journal of biosciences 37 (3), 379–397. o. PMID 22750978.  
  2. A. S. Boyer, S. Grgurevic, C. Cazaux, J. S. Hoffmann (2013. november). „The human specialized DNA polymerases and non-B DNA: vital relationships to preserve genome integrity”. Journal of molecular biology 425 (23), 4767–4781. o. DOI:10.1016/j.jmb.2013.09.022. PMID 24095858.  
  3. J. Choi, T. Majima (2011. december). „Conformational changes of non-B DNA”. Chemical Society reviews 40 (12), 5893–5909. o. DOI:10.1039/c1cs15153c. PMID 21901191.  
  4. Sablon:Ccite journal

Fordítás

Ez a szócikk részben vagy egészben a B-DNA című német Wikipédia-szócikk ezen változatának fordításán alapul. Az eredeti cikk szerkesztőit annak laptörténete sorolja fel. Ez a jelzés csupán a megfogalmazás eredetét és a szerzői jogokat jelzi, nem szolgál a cikkben szereplő információk forrásmegjelöléseként.

Források

További információk

Commons:Category:B-DNA
A Wikimédia Commons tartalmaz B-DNS témájú médiaállományokat.