Uudenkaupungin seurakunta on Uudenkaupungin kaupungissa Varsinais-Suomessa toimiva Suomen evankelis-luterilaisen kirkon seurakunta. Se kuuluu Turun arkkihiippakuntaan ja Nousiaisten rovastikuntaan.
Uusikaupunki erotettiin Kalannin seurakunnasta omaksi seurakunnakseen vuonna 1622, viisi vuotta kaupungin perustamisen jälkeen. Vuosina 1808–1866 se oli Kalantiin kuulunut anneksi, minkä jälkeen se muodostettiin jälleen omaksi seurakunnakseen. Kaupungin lisäksi sen alueeseen kuului myös Uudenkaupungin maalaiskunta.[3]