Als Tochter des Medizinprofessors Johann Ernst Hebenstreit und Halbschwester des Theologieprofessors Hebenstreit erhielt sie eine fundierte Ausbildung in Philosophie, Geschichte, Latein und Griechisch.
Sie war zweimal verheiratet, zunächst 1797 mit dem Rittergutsbesitzer und Kaufmann Lorenz Wilhelm Holderrieder aus Naumburg (Saale) und nach dessen Tod im Jahr 1800 mit Johann Georg Naubert, der ebenfalls Kaufmann in Naumburg war.
Naubert veröffentlichte fast alle ihre Bücher anonym. Aufgrund der Gelehrsamkeit der Bücher kamen mehrere Männer, darunter Johann Friedrich Wilhelm Müller, als mögliche Verfasser ins Gespräch.
Ohne ihre Erlaubnis wurde ihre Identität in einem Artikel in der Zeitung für die elegante Welt 1817 aufgedeckt. Ihren Roman Rosalba (1817) zeichnete sie darauf mit ihrem eigenen Namen. Heute ist Benedikte Naubert weitgehend unbekannt.
In Romanen wie Ulrich Holzer oder Walter von Montbarry nutzt sie bereits das Prinzip, Nebenpersonen der Geschichte zu Hauptpersonen ihrer Romane zu machen. Beispielsweise erleben in Konradin von Schwaben fiktive Personen die Weltgeschichte an der Seite von Königen mit – literarische Techniken, die Walter Scott und auch weniger einflussreiche Schriftsteller wie Ferdinand Grimm dann übernahmen.[2]
Daneben ist sie auch durch ihre Sammlung der Neuen Volksmärchen der Deutschen (1789–1793; Neuauflage 2001) lange vor der Sammlung der Brüder Grimm (1812–1815) wichtig geworden. Es handelt sich freilich um Kunstmärchen, literarische Gestaltungen historischer Stoffe unter Einbeziehung volkstümlicher Motive, nicht um eine Märchensammlung im späteren Sinn. Vergleichbar sind die wenig zuvor erschienenen Märchen von Johann Karl August Musäus.
Heerfort und Klärchen. Etwas für empfindsame Seelen. Frankfurt 1779. Bd.1 online, Bd.2
Geschichte Emma’s, Tochter Kayser Karls des Grossen und seines Geheimschreibers Eginhard. 2 Bände. Leipzig 1785
Walter von Montbarry, Grossmeister des Tempelordens. Leipzig 1786. Bd1. online, Bd2.
Amalgunde Königin von Italien oder das Märchen von der Wunderquelle Eine Sage aus den Zeiten Theoderichs des Großen. 1787. online
Geschichte der Gräfin Thekla von Thurn oder Scenen aus dem dreyssigjährigen Kriege. Leipzig 1788. online
Hatto, Bischoff von Maynz. Sine Legende des zehnten Jahrhunderts. Leipzig 1789. online
Herrmann von Unna. Eine Geschichte aus den Zeiten der Vehmgerichte. Frankfurt 1789. Bd.1 online, Bd.2
Emmy Reinolds, Oder Thorheiten der Großen und Kleinen. 1790. Bd.1 online, Bd.2
Konradin von Schwaben. Oder Geschichte des unglücklichen Enkels Kaiser Friedrichs des Zweiten. 1790. Bd.1 online, Bd.2
Barbara Blomberg, vorgebliche Maitresse Kaiser Karls des Fünften. Eine Originalgeschichte in zwei Theilen. 1790. Bd.1 online, Bd.2
Gebhard Truchses von Waldburg Churfürst von Cöln, oder die astrologischen Fürsten. Leipzig 1791. Bd.1 online, Bd.2
Elisabeth, Erbinn von Toggenburg, oder Geschichte der Frauen von Sargans in der Schweiz. Zweyter Theil. Hohenzollern 1791. Bd.1 online, Bd.2, Bd.3
Alf von Dülmen. Oder Geschichte Kaiser Philipps und seiner Tochter. 1791. Bd.1 online, Bd.2
Die Amtmannin von Hohenweiler. Mannheim 1791. Bd.1 online, Bd.2
Graf Adolph der Vierte aus Schauenburgischem Stamme, Bestätiger der Freiheit Hamburgs. Weygand, Leipzig 1791. online
Edwy und Elgiva oder die Wunder des heiligen Dunstan. Eine altenglische Geschichte. 1791. online
Graf Rosenberg, oder das enthüllte Verbrechen. Leipzig 1791. online, Digitalisat
Werner, Graf von Bernburg. Landes-Industrie-Comptoir, Frankfurt 1791. Bd.1 online, Bd.2
Philippe von Geldern oder Geschichte Selims des Sohns Amurat. Leipzig 1792. online
Miß Louise Fox. Oder Reise einer jungen Engländerin durch einige Gegenden von Deutschland. 1792. online
Conrad und Siegfried von Feuchtwangen, Großmeister des deutschen Ordens. 1792. Bd.1 online, Bd.2
Ulrich Holzer, Bürgermeister in Wien. Leipzig 1793. Bd.1 online, Bd.2
Lord Heinrich Holland, Herzog von Exeter, oder: Irre geleitete Großmuth. Eine Begebenheit aus dem Mittelalter von England. 1794. online
Der Bund des armen Konrads. Getreue Schilderung einiger merkwürdigen Auftritte aus den Zeiten der Bauernkriege des sechszehnten Jahrhunderts. Weygand, Leipzig 1795. online
Wanderungen der Phantasie in die Gebiete der Wahrheit. Weygand, Leipzig 1810
Azaria. Eine Dichtung der Vorwelt. Von der Verfasserin der Thekla von Thurn, des Herrmann von Unna, Walther von Montbarry u. s. w. Weygand, Leipzig 1814
Der kurze Mantel. Und: Ottilie. 2 Volksmährchen. Armbruster, Wien 1819. online
Fontanges, oder das Schicksal der Mutter und der Tochter. Plahn, Kolberg 1824. online
Gewählte Erzählungen. Anthologie aus den Gedichten. Historische Bruchstücke. Bibliographisches Institut, Hildburghausen 1855
Blumenlese aus den Schriften von Benedikte Naubert. Bibliographisches Institut, Hildburghausen 1870. Bd.1 online, Bd.2
Geschichte Heinrich Courtlands, oder selbstgeschafne Leiden. Nach dem Englischen. Weygand, Leipzig (ohne Jahr) online
Die Warnerin. Eine Geschichte aus dem dreißigjährigen Kriege. Die weiße Frau, Herzog Christian von Eisenberg oder: das eisenberger Gespenst. Drei Erzählungen. In einer Transkription von Sylvia Kolbe, Zuerst erschienen 1819. Engelsdorfer Verlag, Leipzig 2014. online
Rezension des „Walter von Montbarry“ (1786), die 1787 erschien
Eva-Maria Bast: Christiane Benedikte Naubert. Der moderne Roman – Vergessene Bestseller-Autorin. In: dies.: Leipziger Frauen. Historische Lebensbilder aus der Bürgerstadt. Bast Medien GmbH, Überlingen 2019, ISBN 978-3-946581-72-7, S. 131–133.
Nikolaus Dorsch (Hrsg.): Sich rettend aus der kalten Würklichkeit. Die Briefe Benedikte Nauberts. Edition – Kritik – Kommentar. Lang, Frankfurt am Main 1986. (Marburger germanistische Studien 6) ISBN 978-3-8204-9787-8
Marianne Henn: Benedikte Naubert. Eine Schriftstellerin als Dienerin „am Altar der Musen.“ In: Thomas Weiss (Hrsg.): Frauen im 18. Jahrhundert. Entdeckungen zu Lebensbildern in Museen und Archiven in Sachsen-Anhalt. Mitteldeutscher Verlag, Halle 2009, ISBN 978-3-89812-648-9, Seite 84–102.
Kurt Schreinert: Benedikte Naubert : ein Beitrag zur Entstehungsgeschichte des historischen Romans in Deutschland, Zugl.: Greifswald, Univ., Habil.-Schr., 1939 u.d.T.: Schreinert, Kurt: Studien zu den Vergangenheitsromanen der Benedikte Naubert, Nendeln/Liechtenstein : Kraus Reprint, 1969 (Original: 1941), Nachdr. d. Ausg. Berlin 1941
↑ abKirchenbuch der Nikolaikirche Leipzig, Seite 498, eingesehen am 1. Oktober 2010
↑Jule Ana Herrmann: Ein Denkmal aus Papier und Tinte. Zum literarischen Einfluss Benedikte Nauberts auf das Werk Ferdinand Grimms. Ergon, Baden-Baden 2020, ISBN 978-3-95650-739-7.