Kalapukan ang Santa Margarita Marsh sa Tinipong Bansa.[1] Ang Santa Margarita Marsh nahimutang sa kondado sa San Diego County ug estado sa California, sa habagatan-kasadpang bahin sa nasod, 3,700 km sa kasadpan sa ulohang dakbayan Washington, D.C.
Ang klima uga. Ang kasarangang giiniton 21 °C. Ang kinainitan nga bulan Septiyembre, sa 26 °C, ug ang kinabugnawan Disyembre, sa 14 °C.[2] Ang kasarangang pag-ulan 229 milimetro matag tuig. Ang kinabasaan nga bulan Disyembre, sa 54 milimetro nga ulan, ug ang kinaugahan Hunyo, sa 1 milimetro.[3]